RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 OR8K1Q8NGG5 319 aa28.06■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 BPIFB1Q8TDL5 484 aa28.06■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 C18orf8Q96DM3 657 aa28.06■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa28.06■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 DNMT3LQ9UJW3 386 aa28.06■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 UNGP13051 313 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 PTPN20Q4JDL3 420 aa28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 EFHC1Q5JVL4 640 aa28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 TMC6Q7Z403 805 aa28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 YAF2Q8IY57 180 aa28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 DRC7Q8IY82 874 aa28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 UBALD2Q8IYN6 164 aa28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC4CQ8WTT0 213 aa28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 RNF139Q8WU17 664 aa28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 PCDHB18PQ96TA0 734 aa28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 CCL26Q9Y258 94 aa28.05■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 BDP1A6H8Y1 2624 aa28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 SERPING1P05155 500 aa28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 OR6B2Q6IFH4 312 aa28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 BEND5Q7L4P6 421 aa28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1958Q8N8K9 716 aa28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 SYT11Q9BT88 431 aa28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 ASNSD1Q9NWL6 643 aa28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 MUTYHQ9UIF7 546 aa28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 CPQQ9Y646 472 aa28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 VCANP13611 3396 aa28.04■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 TBX18O95935 607 aa28.03■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 ERBB2P04626 1255 aa28.03■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 GLI1P08151 1106 aa28.03■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 SKILP12757 684 aa28.03■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 NSFP46459 744 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 FCHO2Q0JRZ9 810 aa28.03■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 SH3RF2Q8TEC5 729 aa28.03■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 FAM149B1Q96BN6 582 aa28.03■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 RSPRY1Q96DX4 576 aa28.03■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 TJP2Q9UDY2 1190 aa28.03■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 SRFP11831 508 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 ALADP13716 330 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 SLC6A3Q01959 620 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 CENPCQ03188 943 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA8FQ08AF8 430 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 HFE2Q6ZVN8 426 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 VPS36Q86VN1 386 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC3BQ96PB8 259 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC7Q99615 494 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 NUDT5Q9UKK9 219 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 STRIP2Q9ULQ0 834 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 DUSP12Q9UNI6 340 aa28.02■■■□□ 2.08
CRIP1-201ENST00000330233 TNFRSF10AO00220 468 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 LEFTY2O00292 366 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF263O14978 683 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 CHADO15335 359 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 DCXO43602 365 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 MMP8P22894 467 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 SCNN1AP37088 669 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 COG7P83436 770 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 GRM2Q14416 872 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 ARID5BQ14865 1188 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 HGSNATQ68CP4 663 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 CNGA4Q8IV77 575 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 EDEM1Q92611 657 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 POPDC2Q9HBU9 364 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 SMPD4Q9NXE4 827 aa28.01■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 GPC5P78333 572 aa28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 PFKPQ01813 784 aa28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 EFEMP1Q12805 493 aa28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 USP4Q13107 963 aa28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF77Q15935 545 aa28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 ACAD10Q6JQN1 1059 aa28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 OLFML1Q6UWY5 402 aa28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 SLC30A5Q8TAD4 765 aa28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 IRF7Q92985 503 aa28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 BRD9Q9H8M2 597 aa28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 MARCH2Q9P0N8 246 aa28■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 CAPN9O14815 690 aa27.99■■■□□ 2.07
CRIP1-201ENST00000330233 HSF2BPO75031 334 aa27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms