RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 CACNB3P54284 484 aa11.69□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 GSRP00390 522 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 DESP17661 470 aa11.68□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 TLR1Q15399 786 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 HADHQ16836 314 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.68□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 CMTM5Q96DZ9 223 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 POPDC2Q9HBU9 364 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 DNAJC28Q9NX36 388 aa11.68□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 RAG1P15918 1043 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 CNTFP26441 200 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 IL1R2P27930 398 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 SERPINB9P50453 376 aa11.68□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 APOFQ13790 326 aa11.68□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 ADRM1Q16186 407 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 MBLAC2Q68D91 279 aa11.68□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 IL31RAQ8NI17 732 aa11.68□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 FAM84AQ96KN4 292 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 AGBL1Q96MI9 1066 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 ZNF778Q96MU6 729 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 C10orf88Q9H8K7 445 aa11.68□□□□□ -0.54
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GINS3-202ENST00000328514 COL20A1Q9P218 1284 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 DTNAQ9Y4J8 743 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.68□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 A0A0J9YVX5 310 aa11.67□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 HMX2A2RU54 273 aa11.67□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 FAM159BA6NKW6 160 aa11.67□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 LGR5O75473 907 aa11.67□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 ENDOD1O94919 500 aa11.67□□□□□ -0.54
GINS3-202ENST00000328514 TNFAIP8O95379 198 aa11.67□□□□□ -0.54
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