RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 NT5DC3Q86UY8 548 aa28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDZD8Q8NEN9 1154 aa28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF139Q8WU17 664 aa28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 HDAC7Q8WUI4 952 aa28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENC1O14682 589 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 RALAP11233 206 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP11AP98196 1134 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS6KA1Q15418 735 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDO1Q16878 200 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRNP1Q6NT89 227 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 BEND5Q7L4P6 421 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A17Q8WUG5 538 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 OVCA2Q8WZ82 227 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 EDEM1Q92611 657 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMG2Q969U7 264 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa28.68■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPCAMP16422 314 aa28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRIP1P48552 1158 aa28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SULT1E1P49888 294 aa28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A52Q3SY17 297 aa28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCD5Q86SK9 330 aa28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBL4BQ8N7F7 174 aa28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYRFLQ96LU7 910 aa28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUSP6Q16828 381 aa28.66■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 HADHQ16836 314 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM172AQ8WUF8 416 aa28.66■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCK2O43639 380 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZMYND10O75800 440 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNA2P51530 1060 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYPL2Q5VXT5 272 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 NMUR1Q9HB89 426 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLIC5Q9NZA1 410 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa28.65■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 FYNP06241 537 aa28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP3CCP48454 512 aa28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBCBQ99426 244 aa28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.64■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM265A0A087WTH1 108 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC66A2RUB6 948 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 M0QYT0 321 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL16O15467 120 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXA9P31269 272 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 STRADAQ7RTN6 431 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHOT1Q8IXI2 618 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPY6RQ99463 290 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM204AQ9H8W3 233 aa28.64■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 XYLBO75191 536 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RARGP13631 454 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 GBP1P32455 592 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCK1P35558 622 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCYL2Q6P3W7 929 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPNE8Q86YQ8 564 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 HES6Q96HZ4 224 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLR10Q9BXR5 811 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLXNA3P51805 1871 aa28.63■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRPSAP2O60256 369 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRCH4O75427 683 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 GJC1P36383 396 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEUP1Q05D60 604 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 NT5C3BQ969T7 300 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 COX16Q9P0S2 106 aa28.62■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSTPIP1O43586 416 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 F9P00740 461 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTNNA2P26232 953 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 MIPP30301 263 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 RDXP35241 583 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGFP49763 221 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 NME3Q13232 169 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 ODF2Q5BJF6 829 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD101Q93033 1021 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCNAQ96QF7 691 aa28.61■■■□□ 2.17
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGFLR1Q9H665 355 aa28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms