RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 KCNK12Q9HB15 430 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TDP1Q9NUW8 608 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ANHXE9PGG2 379 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 DPYSL4O14531 572 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 LTFP02788 710 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 FCARP24071 287 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 CENPCQ03188 943 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 C10orf120Q5SQS8 335 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 VPS36Q86VN1 386 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 EDEM1Q92611 657 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 C11orf70Q9BRQ4 267 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 CD320Q9NPF0 282 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 IGSF9Q9P2J2 1179 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 CCL26Q9Y258 94 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TRIOO75962 3097 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 OLFM2O95897 454 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 WEE1P30291 646 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 CDC25BP30305 580 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 GABRB2P47870 512 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ARID5BQ14865 1188 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 WDR59Q6PJI9 974 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TADA2BQ86TJ2 420 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 RNF135Q8IUD6 432 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 OLIG1Q8TAK6 271 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ELSPBP1Q96BH3 223 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TRPV4Q9HBA0 871 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 MDM4O15151 490 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 MMP8P22894 467 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TC2NQ8N9U0 490 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 SPC24Q8NBT2 197 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 RNF139Q8WU17 664 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 NXPE3Q969Y0 559 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ADAM22Q9P0K1 906 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 CPQQ9Y646 472 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 HEPACAM2A8MVW5 462 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ECI2O75521 394 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 SLC7A9P82251 487 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 SLC6A3Q01959 620 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 EFEMP1Q12805 493 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 TAF5Q15542 800 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 EFHC1Q5JVL4 640 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ACAD10Q6JQN1 1059 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 OLFML1Q6UWY5 402 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 XYLT1Q86Y38 959 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 E2F7Q96AV8 911 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 RSPRY1Q96DX4 576 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 RASAL2Q9UJF2 1139 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 DNMT3LQ9UJW3 386 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXD4-201ENST00000306324 BDP1A6H8Y1 2624 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA8SH3BPF8 625 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 CAPN9O14815 690 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 GRAP2O75791 330 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 NCAM1P13591 858 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 VITQ6UXI7 678 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 MIB1Q86YT6 1006 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF276Q8N554 614 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 KIF9Q9HAQ2 790 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 TTC28Q96AY4 2481 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 ZXDBP98169 803 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 GRM2Q14416 872 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 KLHDC10Q6PID8 442 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 SH3RF2Q8TEC5 729 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 DEF6Q9H4E7 631 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 STRIP2Q9ULQ0 834 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 MUC3AQ02505 3323 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 HSF2BPO75031 334 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 CALB1P05937 261 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXD4-201ENST00000306324 FYNP06241 537 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms