RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 GPAMQ9HCL2 828 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MEI4A8MW99 385 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SREBF1P36956 1147 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MPP3Q13368 585 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MTMR8Q96EF0 704 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB21Q9UL25 225 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF839A8K0R7 811 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM136AQ96C01 138 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SCUBE2Q9NQ36 999 aa24.87■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ARP10275 920 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC11A2P49281 568 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF844Q08AG5 666 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 FGD2Q7Z6J4 655 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 HDDC2Q7Z4H3 204 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 HEATR4Q86WZ0 1026 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CD302Q8IX05 232 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM24O15164 1050 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH1A3P47895 512 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MGAT5Q09328 741 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 OR8H2Q8N162 312 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD54BQ9Y620 910 aa24.86■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 F9P00740 461 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM153BP0C7A2 387 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL21P46778 160 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM153CQ494X1 144 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 BNIPLQ7Z465 357 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM237Q96Q45 408 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SESN1Q9Y6P5 492 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 F5H5T6 163 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP3K13O43283 966 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP4CP60510 307 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS33AQ96AX1 596 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MPP4Q96JB8 637 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TCF7L2Q9NQB0 619 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 POU1F1P28069 291 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 PDIA6Q15084 440 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM9CQ8IZT9 166 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 RAET1EQ8TD07 263 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP2R3CQ969Q6 453 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CES2O00748 559 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 BAIAP3O94812 1187 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 BCAT1P54687 386 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC9A5Q14940 896 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC22A9Q8IVM8 553 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 EMC1Q8N766 993 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3GL1Q99961 368 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN32Q9NX65 697 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SIKE1Q9BRV8 207 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 PIF1Q9H611 641 aa24.85■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CCT8P50990 548 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR49Q8IV35 697 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CASP10Q92851 521 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 GDF3Q9NR23 364 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 COMMD8Q9NX08 183 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SHOC2Q9UQ13 582 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 FCHO1O14526 889 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2F1P24903 491 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 NCKAP1LP55160 1127 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX30Q5VWJ9 437 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TCP10LQ8TDR4 215 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CISHQ9NSE2 258 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 VANGL2Q9ULK5 521 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 NCF4Q15080 339 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 APOPT1Q96IL0 206 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 MYLK2Q9H1R3 596 aa24.84■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 FASP25445 335 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS7P62081 194 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP4Z1Q86W10 505 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRF2Q8IZF7 708 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 VTA1Q9NP79 307 aa24.83■■□□□ 1.57
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT78Q8N1N4 520 aa24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms