RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 RRN3Q9NYV6 651 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 YIPF1Q9Y548 306 aa21.65■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM92AA1XBS5 289 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 H0YGN5 161 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 CTAGE8P0CG41 777 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 PYGMP11217 842 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 IL1R2P27930 398 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 ALDH1A3P47895 512 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 HDAC4P56524 1084 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 CLUL1Q15846 466 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 ODF2Q5BJF6 829 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 MON1AQ86VX9 555 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 EXD1Q8NHP7 514 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 GIPC2Q8TF65 315 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 EDEM1Q92611 657 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 ZWILCHQ9H900 591 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC13Q9NSE7 274 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 EHD2Q9NZN4 543 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJB1P25685 340 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ERVK-21P61565 698 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PLPP4Q5VZY2 271 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO32Q969P5 355 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHL5Q96PQ7 755 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa21.64■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 M0QYT0 321 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 LPXNO60711 386 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CSPG5O95196 566 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT1P04264 644 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SMTNL2Q2TAL5 461 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SCYL2Q6P3W7 929 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC50Q8IVM0 306 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PBX4Q9BYU1 374 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHL11Q9NVR0 708 aa21.63■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PQH9 124 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TGM5O43548 720 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 FGGP02679 453 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RDXP35241 583 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PBX2P40425 430 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 MTMR3Q13615 1198 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 VEPH1Q14D04 833 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB6CQ53S08 254 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 AADACL2Q6P093 401 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 BNIPLQ7Z465 357 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SCD5Q86SK9 330 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB6CQ9H0N0 254 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 GMIPQ9P107 970 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 HIDE1A8MVS5 230 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 GRM6O15303 877 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 ENDOD1O94919 500 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 KLRC2P26717 231 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CETN2P41208 172 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PSEN1P49768 467 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF10Q12962 218 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB30Q15771 203 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 RCOR2Q8IZ40 523 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 PEBP4Q96S96 227 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 NMUR1Q9HB89 426 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 MSRAQ9UJ68 235 aa21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRD1A4D1F6 860 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CSH1P0DML2 217 aa21.61■■□□□ 1.05
PACSIN3-201ENST00000298838 CSH2P0DML3 217 aa21.61■■□□□ 1.05
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