RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 SLC2A14Q8TDB8 520 aa24.95■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 ZBED1O96006 694 aa24.94■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 ATP2C2O75185 946 aa24.92■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 DENND1AQ8TEH3 1009 aa24.92■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TRIM54-201ENST00000296098 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.92■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 SPARCL1Q14515 664 aa24.91■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa24.91■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 A0A1W2PPM1 405 aa24.9■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 FOXN2P32314 431 aa24.9■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 OSTM1Q86WC4 334 aa24.9■■□□□ 1.58
TRIM54-201ENST00000296098 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.9■■□□□ 1.58
TRIM54-201ENST00000296098 KLC2Q9H0B6 622 aa24.9■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 TEX264Q9Y6I9 313 aa24.9■■□□□ 1.58
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TRIM54-201ENST00000296098 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
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TRIM54-201ENST00000296098 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa24.89■■□□□ 1.57
TRIM54-201ENST00000296098 PTGESO14684 152 aa24.88■■□□□ 1.57
TRIM54-201ENST00000296098 GSTA1P08263 222 aa24.88■■□□□ 1.57
TRIM54-201ENST00000296098 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
TRIM54-201ENST00000296098 SLC8A3P57103 927 aa24.88■■□□□ 1.57
TRIM54-201ENST00000296098 CBLBQ13191 982 aa24.88■■□□□ 1.57
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