RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292808.5

ABCF3-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily F member 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene ABCF3, Length 2,453 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3-201ENST00000292808 SDC4P31431 198 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 GRK4P32298 578 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 PTPN9P43378 593 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 CACNA2D1P54289 1103 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 QPCTQ16769 361 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 CA9Q16790 459 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 RFX6Q8HWS3 928 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 ACTL9Q8TC94 416 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 CALN1Q9BXU9 219 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 C9IYK1 514 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 FSBPO95073 299 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 ITGB1P05556 798 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 IL4RP24394 825 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 BRCC3P46736 316 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 LIG3P49916 1009 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 ADIGQ0VDE8 80 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 GRIK3Q13003 919 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 DPYSL3Q14195 570 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 ARCQ7LC44 396 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 25.4
ABCF3-201ENST00000292808 RGS18Q9NS28 235 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 PHF24Q9UPV7 400 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCF3-201ENST00000292808 ACADSBP45954 432 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 NDUFV1P49821 464 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 IFT88Q13099 833 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 TUSC3Q13454 348 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 PGBD4Q96DM1 585 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 PCED1BQ96HM7 432 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 KRT82Q9NSB4 513 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 PRPSAP2O60256 369 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 ITGAVP06756 1048 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 ATP5DP30049 168 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 LHX1P48742 406 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 CDH6P55285 790 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 SNX16P57768 344 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 FAM35AQ86V20 835 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 HASPINQ8TF76 798 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 SMOQ99835 787 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 PTPRDP23468 1912 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 ARVCFO00192 962 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 GDF10P55107 478 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 GPNMBQ14956 572 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 CLLU1OSQ5K130 101 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 PACS2Q86VP3 889 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 TEKT4Q8WW24 435 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 M0QZQ0 153 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 B3GAT3O94766 335 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 MAGEA4P43358 317 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 MAP3K7CLP57077 242 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 PQLC3Q8N755 202 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 CABS1Q96KC9 395 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 TBCBQ99426 244 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 PKMYT1Q99640 499 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 MED10Q9BTT4 135 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.079e-6■■■■■ 32.4
ABCF3-201ENST00000292808 PCDH18Q9HCL0 1135 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 CYP11A1P05108 521 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCF3-201ENST00000292808 SKIP12755 728 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms