RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRB-201ENST00000261266 RIOX2Q8IUF8 465 aa9.32□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 MAML3Q96JK9 1138 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRB-201ENST00000261266 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
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PTPRB-201ENST00000261266 KPNA5O15131 536 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 SERPINE1P05121 402 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 PDGFRBP09619 1106 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 AKR1A1P14550 325 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 PTPN4P29074 926 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 EPHB2P29323 1055 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRB-201ENST00000261266 NCALDP61601 193 aa9.3□□□□□ -0.92
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