RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.64■■□□□ 1.38
RNF170-201ENST00000240159 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.64■■□□□ 1.38
RNF170-201ENST00000240159 ZNF148Q9UQR1 794 aa23.64■■□□□ 1.38
RNF170-201ENST00000240159 FAN1Q9Y2M0 1017 aa23.64■■□□□ 1.38
RNF170-201ENST00000240159 IL4RP24394 825 aa23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 BHLHA9Q7RTU4 235 aa23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 FAM71BQ8TC56 605 aa23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 ART4Q93070 314 aa23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 STAP1Q9ULZ2 295 aa23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.64■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 H3BQF6 201 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 IVDP26440 423 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 ZNF365Q70YC5 407 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 GSTA5Q7RTV2 222 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 VSIG1Q86XK7 387 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 CCDC185Q8N715 623 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 VWCEQ96DN2 955 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 RNF157Q96PX1 679 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 TMEM175Q9BSA9 504 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 WHRNQ9P202 907 aa23.63■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 GOLGA6BA6NDN3 693 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 APOC2P02655 101 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 ITGAVP06756 1048 aa23.62■■□□□ 1.37
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RNF170-201ENST00000240159 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 TMC3Q7Z5M5 1100 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 CEP57Q86XR8 500 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 ALLCQ8N6M5 410 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 LRRC45Q96CN5 670 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 AP4E1Q9UPM8 1137 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 VWA8A3KMH1 1905 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 AGPSO00116 658 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 KRT14P02533 472 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 GALTP07902 379 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 CLTBP09497 229 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 CYP2F1P24903 491 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 KLRC2P26717 231 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 IKBKEQ14164 716 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 TFDP2Q14188 446 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 DPYSL2Q16555 572 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 ALS2CLQ60I27 953 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 FAM131BQ86XD5 332 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 IRGQQ8WZA9 623 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 SNF8Q96H20 258 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 FAM129AQ9BZQ8 928 aa23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 M0QYT0 321 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 CAPN9O14815 690 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 TP73O15350 636 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 LTFP02788 710 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 FGFR3P22607 806 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 L1CAMP32004 1257 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 CALCOCO2Q13137 446 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 SCML4Q8N228 414 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 LRRC43Q8N309 656 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 CCDC89Q8N998 374 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 ZNF670Q9BS34 389 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 USP3Q9Y6I4 520 aa23.61■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.373e-6■■■■■ 44.6
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RNF170-201ENST00000240159 ATF2P15336 505 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 ITIH2P19823 946 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 OAS2P29728 719 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 GGCXP38435 758 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 ADCY8P40145 1251 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 PBX3P40426 434 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 FUT10Q6P4F1 479 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 PRUNE1Q86TP1 453 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 IQCKQ8N0W5 287 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 PIK3R5Q8WYR1 880 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 FAF2Q96CS3 445 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 B3GALT6Q96L58 329 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 TMEM121Q9BTD3 319 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 TXLNGYQ9BZA5 131 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 PATJQ8NI35 1801 aa23.6■■□□□ 1.37
RNF170-201ENST00000240159 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.6■■□□□ 1.37
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