RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PnocQ64387 187 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gga2Q6P5E6 603 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tatdn1Q6P8M1 295 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd300aQ6SJQ0 318 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Reps2Q80XA6 521 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyth4Q80YW0 393 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc9a7Q8BLV3 726 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnali1Q8BVN8 258 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q8BWG4 1187 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm6367Q8C6L9 287 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lsm14bQ8CGC4 385 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pomgnt1Q91X88 660 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdhac2Q91Y09 1006 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bbox1Q924Y0 387 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Eps8l2Q99K30 729 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CoprsQ9CQ13 173 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hsf2bpQ9D4G2 338 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccdc83Q9D4V3 305 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fundc1Q9DB70 155 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AatfQ9JKX4 526 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Egfl7Q9QXT5 275 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Golga5Q9QYE6 729 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Phf2Q9WTU0 1096 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bmp15Q9Z0L4 392 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TfgQ9Z1A1 397 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptgdr2Q9Z2J6 382 aa9.63□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem131O70472 1877 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Taf1Q80UV9 1891 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpine3E9Q6A2 401 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp358E9Q8M1 571 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm8909G3UXE9 396 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm11236J3QMS7 360 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm7694J3QNH8 270 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3739L7N296 216 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Akap1O08715 857 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Edil3O35474 480 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DffaO54786 331 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dkk1O54908 272 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lamp2P17047 415 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lmo2P25801 158 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf19aP50636 840 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pon1P52430 355 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc26a1P58735 704 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lman2lP59481 347 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PhbP67778 272 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Casp4P70343 373 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prdx5P99029 210 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdk16Q04735 496 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam172aQ3TNH5 417 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mylk3Q3UIZ8 795 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm13103Q4VAD2 491 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gngt1Q61012 74 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Usp17laQ61068 526 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 HrQ61645 1182 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt42Q6IFX2 452 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kif11Q6P9P6 1052 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zdhhc19Q810M5 347 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf187Q8BFX1 236 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Csnk1g1Q8BTH8 459 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ldhal6bQ8BVP2 382 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpina3bQ8BYY9 420 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mta1Q8K4B0 715 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Haus3Q8QZX2 570 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 D8Ertd738eQ8R1F0 94 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Uroc1Q8VC12 676 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MgarpQ8VI64 283 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pth2rQ91V95 546 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lims2Q91XD2 341 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PpanQ91YU8 470 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FdpsQ920E5 353 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam49bQ921M7 324 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp64Q99KE8 643 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Lpin3Q99PI4 848 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rnf135Q9CWS1 417 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dcp2Q9CYC6 422 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dlgap1Q9D415 992 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam3aQ9D8T0 230 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cpne8Q9DC53 577 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Capn12Q9ER56 720 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim54Q9ERP3 366 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Caln1Q9JJG7 219 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gabbr1Q9WV18 960 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sgk1Q9WVC6 431 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stat2Q9WVL2 923 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa9.62□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TriobpQ99KW3 2014 aa9.61□□□□□ -0.87
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rtl9Q32KG4 1339 aa9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.9 ms