RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039449.7

Ltn1-201, Transcript of E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltn1, Length 7,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Igfbp6P47880 238 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Abi2P62484 446 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Olfml2bQ3V1G4 746 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gstt1Q64471 240 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Zfyve28Q6ZPK7 905 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Olfr392Q7TRX6 312 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Nup107Q8BH74 926 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Ythdf3Q8BYK6 585 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Swi5Q8K3D3 89 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Lpgat1Q91YX5 370 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 NenfQ9CQ45 171 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Serbp1Q9CY58 407 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Nfu1Q9QZ23 255 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Abcc10Q8R4P9 1501 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Rap1gapA2ALS5 663 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Olfr292F8VQ84 308 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 TfamP40630 243 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Akr1c6P70694 323 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 CcnjlQ5SRT8 387 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 DgkqQ6P5E8 934 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Celf6Q7TN33 460 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Phc3Q8CHP6 981 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Vmn1r218Q8R261 298 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Cd300ldQ8VCH2 221 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 XpotQ9CRT8 963 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gpr63Q9EQQ3 425 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Trpc7Q9WVC5 862 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Morc1Q9WVL5 950 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Cyp2t4E9PWV0 503 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Guca2bO09051 106 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gcnt3Q5JCT0 437 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Phf21aQ6ZPK0 659 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Olfr297Q7TS07 310 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Q80WR5 230 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Sox30Q8CGW4 782 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 OscarQ8VBT3 265 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gm10406A6NAS4 205 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gm3373A6NAS7 205 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gm3252E9PUT9 216 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gm3002E9PW72 216 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gm3298E9PW80 205 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gm3468E9QAJ8 216 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gm3667K7N757 205 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 GclcP97494 637 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Esyt3Q5DTI8 891 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gm3558Q5FWC9 205 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Olfr698Q7TRN4 311 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 H2afy2Q8CCK0 372 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Zfp263Q8CF60 680 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Stx11Q9D3G5 287 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Tnfaip8l2Q9D8Y7 184 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Psma4Q9R1P0 261 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gprin1Q3UNH4 932 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 CttnQ60598 546 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Myl6Q60605 151 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Crtc3Q91X84 619 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Vangl2Q91ZD4 521 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Olig1Q9JKN5 260 aa8.5□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gp1bbP56400 206 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 DselQ0VBN2 1207 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Slc38a5Q3U1J0 479 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Scaf8Q6DID3 1268 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Ifi44Q8BV66 422 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Leg1Q8C6C9 337 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Fam151aQ8QZW3 608 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Smap1Q91VZ6 440 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Trmt11Q9CWH5 460 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Fam227bQ9D518 532 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Ttll9A2APC3 461 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Unc13dB2RUP2 1085 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Usp17lbE9Q9U0 468 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 PolP11369 1281 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Erp29P57759 262 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Tex24Q5DP50 351 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Zbtb5Q7TQG0 670 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Cpne3Q8BT60 533 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Sugp1Q8CH02 643 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Ppp6r2Q8R3Q2 923 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Cyp2c70Q91W64 489 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Gpatch1Q9DBM1 930 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Chd1P40201 1711 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Lcn6A2AJB9 181 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 DcxO88809 366 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Adam15O88839 864 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Marcksl1P28667 200 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Akt1P31750 480 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Sox6P40645 827 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Clec4fP70194 548 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Rnf113a2Q14B01 337 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Grm2Q14BI2 872 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 HpseQ6YGZ1 535 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Olfr212Q7TS33 327 aa8.49□□□□□ -1.05
Ltn1-201ENSMUST00000039449 Moxd2Q7TT41 619 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22 ms