RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gstt1Q64471 240 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf512Q69Z99 562 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tas2r129Q7M709 320 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hamp2Q80T19 83 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppm1eQ80TL0 749 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Armcx3Q8BHS6 379 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb46Q8BID6 600 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfml3Q8BK62 406 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Parp12Q8BZ20 711 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh3rf2Q8BZT2 735 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NelfbQ8C4Y3 580 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem134Q8R0J4 195 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ddx1Q91VR5 740 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DeraQ91YP3 318 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ferd3lQ923Z4 168 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MlklQ9D2Y4 472 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9D4A5 307 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akip1Q9JJR5 212 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sorbs3Q9R1Z8 733 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc2a5Q9WV38 501 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A0A1L1SQF0 893 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gfra2O08842 464 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anp32aO35381 247 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mybpc3O70468 1270 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfrsf17O88472 185 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pak1O88643 545 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prl2c3P04768 224 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CtslP06797 334 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc11a2P49282 568 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tdrd6P61407 2134 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gjb5Q02739 271 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh3bp2Q06649 559 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam171bQ14CH0 825 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q3TQQ9 903 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trappc9Q3U0M1 1148 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc110Q3V125 848 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgef15Q5FWH6 849 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc6a4Q60857 630 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DazlQ64368 298 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tpp2Q64514 1262 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hook1Q8BIL5 728 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ace2Q8R0I0 805 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc30a5Q8R4H9 761 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd207Q8VBX4 331 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab3il1Q8VDV3 383 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyyr1Q8VIH7 165 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Impa2Q91UZ5 290 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zdhhc6Q9CPV7 413 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9DAR0 182 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf6Q9DBU5 667 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc12a7Q9WVL3 1083 aa11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stau1Q9Z108 487 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NbasE9Q411 2356 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rai1Q61818 1889 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BC034090A0A087WP46 1202 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp4a12bA2A974 508 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kdf1A2A9F4 397 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam43bA2AM80 330 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bard1O70445 765 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gabrg2P22723 474 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gria2P23819 883 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sox18P43680 377 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcd1P48410 736 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plk2P53351 682 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Agap2Q3UHD9 1186 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pak6Q3ULB5 682 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc185Q3V118 621 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nab2Q61127 525 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rxfp1Q6R6I7 758 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prl3a1Q78Y73 227 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Neto2Q8BNJ6 525 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem74Q8BQU7 305 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scyl2Q8CFE4 930 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gatad2aQ8CHY6 629 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf426Q8R1D1 550 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh3kbp1Q8R550 709 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdha12Q91Y18 950 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Oas1cQ924S2 362 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elf2Q9JHC9 593 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prl5a1Q9JII2 230 aa11.75□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv5-43A0A0B4J1J2 115 aa11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6657A0A1B0GRJ3 277 aa11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rad51ap2G3UW63 976 aa11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3542K7N6U2 270 aa11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mup5P11591 180 aa11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rrp1P56183 494 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Afg1lQ3V384 480 aa11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arnt2Q61324 712 aa11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scube3Q66PY1 993 aa11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf821Q6PD05 413 aa11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhbdf1Q6PIX5 856 aa11.74□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ldoc1Q7TPY9 151 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.5 ms