RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il21rQ9JHX3 529 aa17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ripk3Q9QZL0 486 aa17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ggps1Q9WTN0 300 aa17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ror2Q9Z138 944 aa17.71■□□□□ 0.43
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccr1P51675 355 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dlg3P70175 849 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PrkciQ62074 595 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dusp16Q6PCP3 660 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc38a7Q8BWH0 463 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap24Q8C4V1 747 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Taf1dQ9D4V4 322 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PirQ9D711 290 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ClcnkbQ9WUB6 687 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Speer3W4VSP1 261 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm44503E9PYU5 387 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtproE9Q612 1226 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PdgfaP20033 211 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccnb1P24860 430 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tfdp1Q08639 410 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cand2Q6ZQ73 1235 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr392Q7TRX6 312 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp1r12bQ8BG95 976 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nudt8Q9CR24 210 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tekt1Q9DAJ2 418 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Limd1Q9QXD8 668 aa17.7■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 StrnO55106 780 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MycnP03966 462 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gsta4P24472 222 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Traf3Q60803 567 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itm2aQ61500 263 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rimbp2Q80U40 1072 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem74Q8BQU7 305 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc80Q8R2G6 949 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Alg9Q8VDI9 611 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mov10l1Q99MV5 1187 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prl2a1Q9JHK0 228 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TfgQ9Z1A1 397 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc8a3S4R2P9 928 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfm1O88998 485 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam172aQ3TNH5 417 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q3TQQ9 903 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sp140Q6NSQ5 534 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NostrinQ6WKZ7 506 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdkn3Q810P3 211 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q8BHN7 327 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FsbpQ8BKE5 299 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DolkQ8R2Y3 534 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itgbl1Q8VDV0 494 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rabep2Q91WG2 554 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nme5Q99MH5 211 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trem2Q99NH8 227 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AadacQ99PG0 398 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Txndc12Q9CQU0 170 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tspan17Q9D7W4 270 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam3aQ9D8T0 230 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ptpn4Q9WU22 926 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm5538W4VSP6 401 aa17.69■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp236S4R299 1847 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r84D3YWE3 849 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnfrsf11bO08712 401 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tnk2O54967 1055 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chrna1P04756 457 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Apba2P98084 750 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Snx27Q3UHD6 539 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Aldh1a2Q62148 518 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dcaf15Q6PFH3 600 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp759Q7M6X3 721 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spata20Q80YT5 790 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxo44Q8BK26 255 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxo33Q8VE08 562 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PrkcdP28867 674 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ItgavP43406 1044 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sem1P60897 70 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NyxP83503 476 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbtb48Q1H9T6 681 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q3UJP5 209 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mfhas1Q3V1N1 1048 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc159Q8C963 411 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc35f5Q8R314 524 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GOLGA7BQ9D428 167 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Actrt1Q9D9J3 376 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcg8Q9DBM0 673 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ParvbQ9ES46 365 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sh2d3cQ9QZS8 854 aa17.68■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpini1O35684 410 aa17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PfkmP47857 780 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DmpkP54265 631 aa17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SnnP61807 88 aa17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Papss1Q60967 624 aa17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54.5 ms