RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641480.1

CASC19-232, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

BASIC

Gene CASC19, Length 1,244 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-232ENST00000641480 TFDP2Q14188 446 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 MORF4L2Q15014 288 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 PDK2Q15119 407 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 RASA2Q15283 850 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ZBTB6Q15916 424 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 KRT71Q3SY84 523 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SEZ6Q53EL9 994 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 XKR4Q5GH76 650 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 C4orf22Q6V702 233 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 BBS12Q6ZW61 710 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 DPH6Q7L8W6 267 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 CATSPER4Q7RTX7 472 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 RSPH3Q86UC2 560 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SESTD1Q86VW0 696 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 XYLT1Q86Y38 959 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 CEP120Q8N960 986 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 TEKT4Q8WW24 435 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 TFAP2BQ92481 460 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ARL8AQ96BM9 186 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 VWCEQ96DN2 955 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 CCDC114Q96M63 670 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SAMD11Q96NU1 681 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SERPINB12Q96P63 405 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 CNPY3Q9BT09 278 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 RSAD1Q9HA92 442 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 TMEM51Q9NW97 253 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 HESX1Q9UBX0 185 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 FETUBQ9UGM5 382 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 AGAP1Q9UPQ3 857 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 TRIP11Q15643 1979 aa7.56□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 EPOPA6NHQ4 379 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 M0QYV0 167 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 M0QZ92 97 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ARHGAP33O14559 1287 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 RIPK2O43353 540 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 LPXNO60711 386 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 GJB5O95377 273 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 TTC4O95801 387 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 APOC2P02655 101 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 MYL3P08590 195 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SELPP16109 830 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 GPD1P21695 349 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 KLRC2P26717 231 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ADCY8P40145 1251 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 CDKN2BP42772 138 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 GPD2P43304 727 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SSR1P43307 286 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 PSEN2P49810 448 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 BCAT1P54687 386 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 TAS2R40P59535 323 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 IKBKEQ14164 716 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 STAT4Q14765 748 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SV2CQ496J9 727 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 BOLA3Q53S33 107 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ALKAL1Q6UXT8 129 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 RPAINQ86UA6 219 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ALLCQ8N6M5 410 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 P3H4Q92791 437 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 HSFY1Q96LI6 401 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 CFAP57Q96MR6 1250 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 TRIM31Q9BZY9 425 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 EPN3Q9H201 632 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SLC38A7Q9NVC3 462 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 PRDM4Q9UKN5 801 aa7.55□□□□□ -1.2
CASC19-232ENST00000641480 POLIQ9UNA4 740 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms