RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640640.1

SCARB2-223, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

TSL 5 BASIC

Gene SCARB2, Length 4,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-223	ENST00000640640	KRT33B	Q14525	404 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	MFSD10	Q14728	455 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ACAP1	Q15027	740 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	RIPK3	Q9Y572	518 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	NCAN	O14594	1321 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	E2F6	O75461	281 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	RECQL4	O94761	1208 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	MYBL2	P10244	700 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	SSTR1	P30872	391 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	MAMLD1	Q13495	774 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	HEY2	Q9UBP5	337 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	DSE	Q9UL01	958 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	CCNE2	O96020	404 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	IRF1	P10914	325 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	CPA2	P48052	419 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	LRRC43	Q8N309	656 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	FBXO32	Q969P5	355 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	HES6	Q96HZ4	224 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	NSL1	Q96IY1	281 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	CDT1	Q9H211	546 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		18.18	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	TTC36	A6NLP5	189 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	PYGL	P06737	847 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ITIH4	Q14624	930 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	TTC23L	Q6PF05	361 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	PGM2	Q96G03	612 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	KCNK16	Q96T55	309 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ALDH1A3	P47895	512 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	RBBP7	Q16576	425 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	C2CD2L	O14523	706 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	POMC	P01189	267 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	APOC2	P02655	101 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	AXL	P30530	894 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	TNFSF9	P41273	254 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	PRELID2	Q8N945	189 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	EDEM1	Q92611	657 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		18.17	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	AIM2	O14862	343 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ANGPT2	O15123	496 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	TIMM44	O43615	452 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	SLC6A3	Q01959	620 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	FAM84A	Q96KN4	292 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	TINF2	Q9BSI4	451 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	AKR1A1	P14550	325 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	CNGA2	Q16280	664 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	TMEM169	Q96HH4	297 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	CENPK	Q9BS16	269 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	NFIC	P08651	508 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	PSEN2	P49810	448 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	RPAIN	Q86UA6	219 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ADAMTS3	O15072	1205 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	NCAM2	O15394	837 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	HMOX2	P30519	316 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	DEFB106A	Q8N104	65 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ABCC6	O95255	1503 aa		18.16	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	ALDH1A1	P00352	501 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	APOA4	P06727	396 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	GHR	P10912	638 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	BMPR2	Q13873	1038 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	TBCC	Q15814	346 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	MOB2	Q70IA6	237 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	AMPD1	P23109	780 aa		18.15	■□□□□ 0.5
SCARB2-223	ENST00000640640	CCND1	P24385	295 aa		18.15	■□□□□ 0.5

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