RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-222	ENST00000639501	PEX6	Q13608	980 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	NPNT	Q6UXI9	565 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	LRCH4	O75427	683 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ITGA2B	P08514	1039 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TSHR	P16473	764 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	AOC1	P19801	751 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ATG16L1	Q676U5	607 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		21.3	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF132	P52740	706 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	IRX4	P78413	519 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	MMEL1	Q495T6	779 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TRIM74	Q86UV6	250 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TRIM73	Q86UV7	250 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CALB1	P05937	261 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	KDELR1	P24390	212 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	KCNJ11	Q14654	390 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TRIP10	Q15642	601 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	JDP2	Q8WYK2	163 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		21.29	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	VILL	O15195	856 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	RBP3	P10745	1247 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	PSMA2	P25787	234 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	DEUP1	Q05D60	604 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SEZ6	Q53EL9	994 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CEP170P1	Q96L14	293 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	APOL6	Q9BWW8	343 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ARID2	Q68CP9	1835 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ITM2A	O43736	263 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CSH1	P0DML2	217 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CSH2	P0DML3	217 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	LIG4	P49917	911 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CHN2	P52757	468 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	RFX6	Q8HWS3	928 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	WDR81	Q562E7	1941 aa		21.28	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	RAG1	P15918	1043 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	TBCC	Q15814	346 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	FAXC	Q5TGI0	409 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ILDR2	Q71H61	639 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	GCNA	Q96QF7	691 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	MIS12	Q9H081	205 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	21.27	■■□□□ 1	5e-8	■■■■■ 189.5
PMS1-222	ENST00000639501	HMX2	A2RU54	273 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ATP9B	O43861	1147 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	PROC	P04070	461 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	BPGM	P07738	259 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	EMC1	Q8N766	993 aa		21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
PMS1-222	ENST00000639501	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PMS1-222	ENST00000639501	WDR64	B1ANS9	1081 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PMS1-222	ENST00000639501		H3BNX3	289 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PMS1-222	ENST00000639501	KRT37	O76014	449 aa		21.26	■□□□□ 0.99
PMS1-222	ENST00000639501	FAM200B	P0CF97	657 aa		21.26	■□□□□ 0.99

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