RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634658.1

HCN1-202, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCN1, Length 4,738 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-202ENST00000634658 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 CDCA5Q96FF9 252 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 TMEM169Q96HH4 297 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 TBCBQ99426 244 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 CD274Q9NZQ7 290 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 DISP2A7MBM2 1401 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 TIMM44O43615 452 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 LHX1P48742 406 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 VGLL4Q14135 290 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 SLC9A9Q8IVB4 645 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 EME1Q96AY2 570 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 SYT15Q9BQS2 421 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 ZNF446Q9NWS9 450 aa20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 GLRA2P23416 452 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 MIPP30301 263 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 GLRBP48167 497 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 RGS4P49798 205 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 KLC1Q07866 573 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 GPC2Q8N158 579 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 EDEM1Q92611 657 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 GDF3Q9NR23 364 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 TGFB1I1O43294 461 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 RHOBTB1O94844 696 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 SUPT7LO94864 414 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 FBXO21O94952 628 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 PTPN7P35236 360 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 ARSHQ5FYA8 562 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 SHC3Q92529 594 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 NOD2Q9HC29 1040 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 VTA1Q9NP79 307 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 ADIGQ0VDE8 80 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 RFWD2Q8NHY2 731 aa20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 MICAL2O94851 1124 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 UBOX5O94941 541 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 SCTRP47872 440 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 POTEAQ6S8J7 498 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 APOA4P06727 396 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 PAEPP09466 180 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 COPAP53621 1224 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 ITIH4Q14624 930 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 TTC30AQ86WT1 665 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 KCNK1O00180 336 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 MAP2K7O14733 419 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 ASMTLO95671 621 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 INPP5AQ14642 412 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 DNAJC9Q8WXX5 260 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 COPS5Q92905 334 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 SPATA17Q96L03 361 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN1-202ENST00000634658 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.27■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 AKAP10O43572 662 aa20.27■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 SLC11A2P49281 568 aa20.27■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 MRNIPQ6NTE8 343 aa20.27■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 C16orf89Q6UX73 402 aa20.27■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 STRA8Q7Z7C7 330 aa20.27■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.27■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.27■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 E5RJQ4 531 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 IRF6O14896 467 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 POMCP01189 267 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 ST8SIA6P61647 398 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 EFEMP1Q12805 493 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 MPP3Q13368 585 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 MRGBPQ9NV56 204 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 AVPR1AP37288 418 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 RNF19AQ9NV58 838 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 MRC1P22897 1456 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HCN1-202ENST00000634658 PBX1P40424 430 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms