RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631043.2

TCF4-275, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-275	ENST00000631043	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	GPC2	Q8N158	579 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	GCNT4	Q9P109	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ZNF263	O14978	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	AKR1B10	O60218	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TACC1	O75410	805 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	STAM2	O75886	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	AKAP3	O75969	853 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SERPING1	P05155	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PLS3	P13797	630 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PRKCI	P41743	596 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	RARRES1	P49788	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	GTF2A2	P52657	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	COPA	P53621	1224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	HMGCS2	P54868	508 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	JAM2	P57087	298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ERVFRD-1	P60508	538 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PSMC5	P62195	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MYL7	Q01449	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CAP1	Q01518	475 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PFKP	Q01813	784 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PLP2	Q04941	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SPP2	Q13103	211 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PRKG2	Q13237	762 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	LAPTM5	Q13571	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SLC9A5	Q14940	896 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	DDR2	Q16832	855 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	NSMF	Q6X4W1	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	DAW1	Q8N136	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-275	ENST00000631043	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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