RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628742.2

SOX9-AS1-218, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 733 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TACC1O75410 805 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADH1CP00326 375 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GARTP22102 1010 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RDXP35241 583 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLC6A11P48066 632 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF132P52740 706 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MYL7Q01449 175 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF33AQ06730 810 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KCNB1Q14721 858 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 POSTNQ15063 836 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SDHAF4Q5VUM1 108 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADALQ6DHV7 355 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KIAA1211LQ6NV74 962 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MIB1Q86YT6 1006 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CCDC33Q8N5R6 958 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TERB1Q8NA31 727 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 STKLD1Q8NE28 680 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RLN3Q8WXF3 142 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BICD1Q96G01 975 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KIF2CQ99661 725 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SEL1LQ9UBV2 794 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CDH9Q9ULB4 789 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NME7Q9Y5B8 376 aa7.21□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 K7ENM7 598 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRIM66O15016 1216 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HUS1O60921 280 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TULP3O75386 442 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 APODP05090 189 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ITGB3P05106 788 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SYPP08247 313 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADH5P11766 374 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LMO2P25791 158 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NTSR1P30989 418 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MAPK8P45983 427 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BNC1Q01954 994 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RESTQ13127 1097 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PTPRNQ16849 979 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 EMC10Q5UCC4 262 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 BRICD5Q6PL45 260 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 GPBP1Q86WP2 473 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NAXDQ8IW45 347 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADGRF2Q8IZF7 708 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ZNF276Q8N554 614 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CADM4Q8NFZ8 388 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADAM32Q8TC27 787 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 RAD54LQ92698 747 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCED1BQ96HM7 432 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SUSD2Q9UGT4 822 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PTPRJQ12913 1337 aa7.2□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 CKAP5Q14008 2032 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NPC1O15118 1278 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 HCRTO43612 131 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 SH3BP5O60239 455 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 C1QL1O75973 258 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LDHAP00338 332 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 PLCG1P19174 1290 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 NDUFV2P19404 249 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 DDIT3P35638 169 aa7.19□□□□□ -1.26
SOX9-AS1-218ENST00000628742 LONP1P36776 959 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms