RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 LRMPQ12912 555 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 SYCP1Q15431 976 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP135Q66GS9 1140 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF560Q96MR9 790 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA1586Q9HCI6 787 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT6Q9Y6F9 365 aa25.61■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 MFAP3LO75121 409 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 IL18RAPO95256 599 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 AFPP02771 609 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CASP4P49662 377 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPY1Q01534 308 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNH2Q12809 1159 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 DMC1Q14565 340 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 GAB4Q2WGN9 574 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 POMGNT1Q8WZA1 660 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35C1Q96A29 364 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 WASF3Q9UPY6 502 aa25.6■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRDO14764 452 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 PMM2O15305 246 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGB3P05106 788 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 PNPLA4P41247 253 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 ZXDBP98169 803 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 AMPD2Q01433 879 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CPA6Q8N4T0 437 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CD101Q93033 1021 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPBP1Q9NZL4 362 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 SIX4Q9UIU6 781 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP205Q92621 2012 aa25.59■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf78A6NCI8 922 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 APBB3O95704 486 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 CASP14P31944 242 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF43Q68DV7 783 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 OR8K1Q8NGG5 319 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM213AQ9BRX8 229 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00597Q9H2U6 94 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 GDAP2Q9NXN4 497 aa25.58■■□□□ 1.69
CAPNS1-216ENST00000628306 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
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CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP13Q12802 2813 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 GIPC1O14908 333 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 P4HA2O15460 535 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP6O43182 974 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TCF3P15923 654 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
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CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP221Q4G0U5 840 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 SAAL1Q96ER3 474 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC7Q99615 494 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 CBWD1Q9BRT8 395 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 EDEM2Q9BV94 578 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 PYCARDQ9ULZ3 195 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRDP23468 1912 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 HELZP42694 1942 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 IGF2RP11717 2491 aa25.57■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT13P13646 458 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 OPRD1P41143 372 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2J2P51589 502 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ADKP55263 362 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNMA1Q12791 1236 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM171BQ6P995 826 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM139Q8IV31 216 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM86AQ8N2M4 240 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPC7Q9HCX4 862 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNA1GO43497 2377 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 LNP1A1A4G5 178 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 K7EQS6 105 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L7P0C7H9 530 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT9P35527 623 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 CREB5Q02930 508 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 SOWAHAQ2M3V2 549 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 RASSF3Q86WH2 238 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 TMC2Q8TDI7 906 aa25.56■■□□□ 1.68
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3RF2Q8TEC5 729 aa25.56■■□□□ 1.68
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