RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624927.3

LINC01128-215, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1128, human

TSL 5

Gene LINC01128, Length 677 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01128-215	ENST00000624927	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SSH2	Q76I76	1423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927		H0YIZ8	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ALDH2	P05091	517 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	CYP2C9	P11712	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	CERS1	P27544	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	CYP2C18	P33260	490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	LIPA	P38571	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	FGL2	Q14314	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	REPS1	Q96D71	796 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927		A0A088AWK7	358 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	MYO1C	O00159	1063 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF213	O14771	459 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ABLIM3	O94929	683 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	LRPAP1	P30533	357 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PDE1A	P54750	535 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ANAPC15	P60006	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	BTAF1	O14981	1849 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	AP1G1	O43747	822 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	LATS1	O95835	1130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	FES	P07332	822 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	NPS	P0C0P6	89 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PRR35	P0CG20	571 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	CLCN2	P51788	898 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	WNT3	P56703	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	TUBA4A	P68366	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	GTF2H3	Q13889	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINC01128-215	ENST00000624927	SBF1	O95248	1867 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	COL18A1	P39060	1754 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	NAIP	Q13075	1403 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927		A1L4Q6	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	ENG	P17813	658 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	KEL	P23276	732 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINC01128-215	ENST00000624927	UCP3	P55916	312 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms