RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614696.4

CDK1-209, Transcript of cyclin dependent kinase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CDK1, Length 1,884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1-209ENST00000614696 MPLP40238 635 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.873e-7■■■■□ 20.4
CDK1-209ENST00000614696 MYO1EQ12965 1108 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 PMS2P11Q13670 270 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 NPY5RQ15761 445 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 FAM209BQ5JX69 171 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 ATP11CQ8NB49 1132 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 DEPTORQ8TB45 409 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 IQCDQ96DY2 449 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 TNIP3Q96KP6 325 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 MYD88Q99836 296 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 NLRC4Q9NPP4 1024 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 MYO1AQ9UBC5 1043 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 MID2Q9UJV3 735 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 LAMB4A4D0S4 1761 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 ZNF804BA4D1E1 1349 aa3.4□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 SLIT2O94813 1529 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 CLCA1A8K7I4 914 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 H7C4K7 107 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 TRIAP1O43715 76 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 RASSF9O75901 435 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 FGF18O76093 207 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 A1BGP04217 495 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 KCNA3P22001 575 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 DGKEP52429 567 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 LBX1P52954 281 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 CACNA2D1P54289 1103 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 KRT17Q04695 432 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 BRD3Q15059 726 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 MGAT5BQ3V5L5 792 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 ARHGAP40Q5TG30 622 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 VWA1Q6PCB0 445 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 LAYNQ6UX15 382 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 USP43Q70EL4 1123 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 FAM186BQ8IYM0 893 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 PMM1Q92871 262 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 KIAA1191Q96A73 305 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 RPS6KC1Q96S38 1066 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 PPP1R9BQ96SB3 815 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 SERHLQ9NQF3 203 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 GJB4Q9NTQ9 266 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 DMTF1Q9Y222 760 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 RALGAPBQ86X10 1494 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 VWC2LB2RUY7 222 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 APOL1O14791 398 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 INSIG1O15503 277 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 CCP110O43303 1012 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 RHOP08100 348 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 PDHA1P08559 390 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 MT3P25713 68 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 ACVR2AP27037 513 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 IL1R2P27930 398 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 LRPAP1P30533 357 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 SP2Q02086 613 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 IZUMO3Q5VZ72 239 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 RNF44Q7L0R7 432 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 SPICE1Q8N0Z3 855 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 VGLL2Q8N8G2 317 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 BPIFB1Q8TDL5 484 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 FAM136AQ96C01 138 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 Q96MF0 132 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 ACTRT3Q9BYD9 372 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 CERS4Q9HA82 394 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 KCTD5Q9NXV2 234 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 TAGLN3Q9UI15 199 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 SERTAD3Q9UJW9 196 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 HDAC9Q9UKV0 1011 aa3.39□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 MAST3O60307 1309 aa3.38□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa3.38□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 RAB27BO00194 218 aa3.38□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 PPM1DO15297 605 aa3.38□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 RARRES1P49788 294 aa3.38□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 BIRC2Q13490 618 aa3.38□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CDK1-209ENST00000614696 SLC35G1Q2M3R5 365 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms