RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 SDCBP2Q9H190 292 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 VRTNQ9H8Y1 702 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 IL37Q9NZH6 218 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP8B3O60423 1300 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D3BA6NDS4 549 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TULP3O75386 442 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK8P45983 427 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 BMT2Q1RMZ1 405 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A2Q9NP94 309 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 HCN2Q9UL51 889 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM24O15164 1050 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CUTAO60888 179 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 IRF1P10914 325 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ENGP17813 658 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PGFP49763 221 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBP50607 506 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 BIRC3Q13489 604 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF699Q32M78 642 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 LYSMD4Q5XG99 296 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 BTBD8Q5XKL5 378 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM25Q86YD3 366 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 FUKQ8N0W3 1084 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SMARCD1Q96GM5 515 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM33Q9BZ11 813 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 FSCN3Q9NQT6 498 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SPHK2Q9NRA0 654 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT82Q9NSB4 513 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 DEC1Q9P2X7 70 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM92AA1XBS5 289 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC3O60645 756 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CLSTN1O94985 981 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ITPKAP23677 461 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ANO4Q32M45 955 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf76Q5T2E6 689 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MIB1Q86YT6 1006 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TERB1Q8NA31 727 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZMIZ2Q8NF64 920 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PILRBQ9UKJ0 227 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP295Q9C0D2 2601 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 AP1G2O75843 785 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 BEST1O76090 585 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 YEATS4O95619 227 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRG2P18507 467 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF667Q5HYK9 610 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SPDYCQ5MJ68 293 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC23A3Q6PIS1 610 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ACOT1Q86TX2 421 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TNIP3Q96KP6 325 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SMOQ99835 787 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 SCNM1Q9BWG6 230 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEF1Q9HAY2 307 aa27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 VNN1O95497 513 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC130P13994 396 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 WASP42768 502 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ORC1Q13415 861 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 NCOA4Q13772 614 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB119Q8N690 84 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNV2Q8TDN2 545 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 PARD3BQ8TEW8 1205 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 NACA2Q9H009 215 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 COMMD8Q9NX08 183 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGXB4Q9UGU5 601 aa27.15■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 MYOFQ9NZM1 2061 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 GREM1O60565 184 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CFIP05156 583 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXB2P14652 356 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN10P78369 228 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CUL4BQ13620 913 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1211LQ6NV74 962 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 GATA6Q92908 595 aa27.14■■□□□ 1.94
CAPNS1-211ENST00000590874 CHD6Q8TD26 2715 aa27.14■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQF6 199 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 TLR5O60602 858 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 DPP6P42658 865 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A14Q8TDB8 520 aa27.13■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-211ENST00000590874 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
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