RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	C4orf47	A7E2U8	309 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	TRIM24	O15164	1050 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	AP1G2	O75843	785 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	KCNK5	O95279	499 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	APOD	P05090	189 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	HECTD3	Q5T447	861 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	HCN2	Q9UL51	889 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ATP8B3	O60423	1300 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422		A0A0A0MRY4	1105 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	FAM92A	A1XBS5	289 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	GREM1	O60565	184 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	NR3C1	P04150	777 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	SLFN14	P0C7P3	912 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	IRF1	P10914	325 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	P2RY2	P41231	377 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	GRIA2	P42262	883 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ASPA	P45381	313 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	TUB	P50607	506 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	NDST1	P52848	882 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	SHC2	P98077	582 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ZACN	Q401N2	412 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM25	Q86YD3	366 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	MIB1	Q86YT6	1006 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	NAT16	Q8N8M0	369 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	C12orf29	Q8N999	325 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	HMGB4	Q8WW32	186 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	PAGE5	Q96GU1	130 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	TNIP3	Q96KP6	325 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	TWNK	Q96RR1	684 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	EXOC1	Q9NV70	894 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	OSER1	Q9NX31	292 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	IGF2R	P11717	2491 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	TLR5	O60602	858 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	TULP3	O75386	442 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	TBX18	O95935	607 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	PFKFB1	P16118	471 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	PTGER3	P43115	390 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	AP3M2	P53677	418 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	MAP3K7CL	P57077	242 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	IRX4	P78413	519 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ATL3	Q6DD88	541 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	SV2A	Q7L0J3	742 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	C11orf74	Q86VG3	221 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	WHAMM	Q8TF30	809 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	PIGK	Q92643	395 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	SPEG	Q15772	3267 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422		A0A1B0GVL5	298 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	HHLA1	C9JL84	531 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	CYP26A1	O43174	497 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ALDH1A2	O94788	518 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CTIF-208	ENST00000590422	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36

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