RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 Q7L0L9 218 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 OTUD6AQ7L8S5 288 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 DLG3Q92796 817 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 APBB2Q92870 758 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 LTBP2Q14767 1821 aa8.38□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 SCN5AQ14524 2016 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 FRS3O43559 492 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 SLITRK3O94933 977 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 RHOBTB3O94955 611 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 STBD1O95210 358 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 AMHP03971 560 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 HTR1BP28222 390 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 PIK3CBP42338 1070 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TXKP42681 527 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 RXRGP48443 463 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 MGAT3Q09327 533 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CALCRLQ16602 461 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 UGT8Q16880 541 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 UAP1L1Q3KQV9 507 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE3BQ5TA77 95 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 C4orf19Q8IY42 314 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 METTL13Q8N6R0 699 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 MTMR9Q96QG7 549 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 RAD9AQ99638 391 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TRPV2Q9Y5S1 764 aa8.37□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 H3BQV1 296 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF205O95201 554 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 EOMESO95936 686 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 GLB1P16278 677 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TNFAIP3P21580 790 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TNFSF4P23510 183 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 GJB2P29033 226 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 MCM7P33993 719 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 RABGGTBP53611 331 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 WDR5P61964 334 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 PDIA5Q14554 519 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 LPIN1Q14693 890 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TCTN1Q2MV58 587 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ANO4Q32M45 955 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 NCAPH2Q6IBW4 605 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 CFAP161Q6P656 301 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ACAD11Q709F0 780 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 MYCT1Q8N699 235 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TOP1MTQ969P6 601 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 Q96M66 194 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 KCNJ15Q99712 375 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 HSD17B14Q9BPX1 270 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 VAV3Q9UKW4 847 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 INSL6Q9Y581 213 aa8.36□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A087WV62 115 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.35□□□□□ -1.07
EFTUD2-216ENST00000590105 DYTNA2CJ06 578 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms