RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 ACOX2Q99424 681 aa18.64■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 SLC6A17Q9H1V8 727 aa18.64■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 STK17AQ9UEE5 414 aa18.64■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa18.64■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 LAMA5O15230 3695 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1W2PQF6 199 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 YWHAQP27348 245 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM25Q86YD3 366 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CBWD2Q8IUF1 395 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 NAXDQ8IW45 347 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 MDM1Q8TC05 714 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 WBP2Q969T9 261 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 ELOVL4Q9GZR5 314 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 OLFML3Q9NRN5 406 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 RAD54BQ9Y620 910 aa18.63■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 A0A1W2PQD8 194 aa18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 GJB3O75712 270 aa18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 MAOBP27338 520 aa18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 DUOXA2Q1HG44 320 aa18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 SV2BQ7L1I2 683 aa18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CHPFQ8IZ52 775 aa18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 KCNV2Q8TDN2 545 aa18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 OTUB2Q96DC9 234 aa18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 SPHK2Q9NRA0 654 aa18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 PTPRBP23467 1997 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF233A6NK53 670 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 NDUFS2O75306 463 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF217O75362 1048 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 GRIK2Q13002 908 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 HECTD3Q5T447 861 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 GRAMD4Q6IC98 578 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 NUDT18Q6ZVK8 323 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 NUP93Q8N1F7 819 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 SCAMP5Q8TAC9 235 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 TMX3Q96JJ7 454 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 B3GNT5Q9BYG0 378 aa18.61■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 TNNC1P63316 161 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 SLC14A1Q13336 389 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 ALCAMQ13740 583 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 SDE2Q6IQ49 451 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 WDR49Q8IV35 697 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 KCNK16Q96T55 309 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 TRIM9Q9C026 710 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 NACA2Q9H009 215 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 PANK4Q9NVE7 773 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 GMIPQ9P107 970 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 RAXQ9Y2V3 346 aa18.6■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 A8MXQ7 604 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 TACC1O75410 805 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CST3P01034 146 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 NEFLP07196 543 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 DLATP10515 647 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 GNSP15586 552 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 SURF1Q15526 300 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 SYCP2LQ5T4T6 812 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CLIC6Q96NY7 704 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CD248Q9HCU0 757 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 SUSD2Q9UGT4 822 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 STARD13Q9Y3M8 1113 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 CLIC4Q9Y696 253 aa18.59■□□□□ 0.57
CCDC40-211ENST00000574099 MEI4A8MW99 385 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 PRRT4C9JH25 899 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 TXLNAP40222 546 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 SLC5A3P53794 718 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 WDR72Q3MJ13 1102 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 TPGS1Q6ZTW0 290 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 BRAPQ7Z569 592 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 SLCO6A1Q86UG4 719 aa18.58■□□□□ 0.56
CCDC40-211ENST00000574099 RDH13Q8NBN7 331 aa18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms