RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPM1JQ5JR12 505 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 HECTD3Q5T447 861 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 EMC10Q5UCC4 262 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 RHBDF2Q6PJF5 856 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYT13Q7L8C5 426 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALLCQ8N6M5 410 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 BHMTQ93088 406 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 PNKPQ96T60 521 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 RTKNQ9BST9 563 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.59□□□□□ -1.19
CCNDBP1-212ENST00000567690 DMDP11532 3685 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PQH9 124 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 SGK1O00141 431 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC30A4O14863 429 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM24O15164 1050 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLR5O60602 858 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRP3O75074 770 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF202O95125 648 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYL1P05976 194 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 PFKLP17858 780 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 ACO1P21399 889 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 SDHBP21912 280 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCKDHBP21953 392 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 MXI1P50539 228 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADAM9Q13443 819 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 ELF2Q15723 593 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLK5Q496M5 336 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 C10orf76Q5T2E6 689 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 BTBD8Q5XKL5 378 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL31Q6EBC2 164 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 UNC93AQ86WB7 457 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL17RCQ8NAC3 791 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 HMGB4Q8WW32 186 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 RLN3Q8WXF3 142 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAF4BQ92750 862 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 GBP4Q96PP9 640 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARID3AQ99856 593 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 OSER1Q9NX31 292 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYOFQ9NZM1 2061 aa7.58□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PQ27 194 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PQ64 194 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PQD8 194 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 E2F8A0AVK6 867 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 IKBKBO14920 756 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CILPO75339 1184 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TULP3O75386 442 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 HMBSP08397 361 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRIA2P42262 883 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 INCA1Q0VD86 236 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRY1Q16526 586 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 C10orf120Q5SQS8 335 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TPGS1Q6ZTW0 290 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM25Q86YD3 366 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 MIB1Q86YT6 1006 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRYBG2Q8N1P7 616 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 PGBD3Q8N328 593 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 WHAMMQ8TF30 809 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEMA4DQ92854 862 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.57□□□□□ -1.2
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms