RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CHP1-208	ENST00000560965	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		6.09	□□□□□ -1.43
CHP1-208	ENST00000560965	MYO9B	Q13459	2157 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	LCHN	A4D1U4	455 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965		O00370	1275 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CYP26A1	O43174	497 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CCP110	O43303	1012 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	PAPLN	O95428	1278 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	LCA5L	O95447	670 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ALB	P02768	609 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ATF2	P15336	505 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	NPR3	P17342	541 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CD58	P19256	250 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	LMO2	P25791	158 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	HOXA9	P31269	272 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	SCNN1A	P37088	669 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	USP8	P40818	1118 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ACADSB	P45954	432 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	PPP3CC	P48454	512 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	RABGGTB	P53611	331 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CDH8	P55286	799 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	KRT83	P78385	493 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	SLC18A3	Q16572	532 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	RTP2	Q5QGT7	225 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ARC	Q7LC44	396 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	TMC7	Q7Z402	723 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CEP57	Q86XR8	500 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	HASPIN	Q8TF76	798 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	POF1B	Q8WVV4	589 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	SPATA17	Q96L03	361 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	C8orf48	Q96LL4	319 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	PKMYT1	Q99640	499 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	AGPAT1	Q99943	283 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	TCF25	Q9BQ70	676 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	SYT11	Q9BT88	431 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	DUSP16	Q9BY84	665 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	DEF6	Q9H4E7	631 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	MARK1	Q9P0L2	795 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	POLI	Q9UNA4	740 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ASB3	Q9Y575	518 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	THAP12	O43422	761 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	AKR1B10	O60218	316 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	SIN3B	O75182	1162 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	FBXO21	O94952	628 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	FGF19	O95750	216 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	GLUD1	P00367	558 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	FAM200B	P0CF97	657 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	FAM157B	P0CG42	384 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CPB1	P15086	417 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	CD19	P15391	556 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	TNFAIP3	P21580	790 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CHP1-208	ENST00000560965	ELF1	P32519	619 aa		6.07	□□□□□ -1.44

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