RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	GPR35	Q9HC97	309 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	RLIM	Q9NVW2	624 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	POLL	Q9UGP5	575 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TAF1	P21675	1872 aa		5.25	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TBX3	O15119	743 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PMM2	O15305	246 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MGEA5	O60502	916 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJB5	O75953	348 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	UNC5C	O95185	931 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MYL3	P08590	195 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA31D3	P0C874	917 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MX1	P20591	662 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	NR4A1	P22736	598 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	GYG1	P46976	350 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	OCA2	Q04671	838 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	UBE4A	Q14139	1066 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	EMC10	Q5UCC4	262 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	IL31	Q6EBC2	164 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF276	Q8N554	614 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	APIP	Q96GX9	242 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	GPR20	Q99678	358 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SYT17	Q9BSW7	474 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CHST12	Q9NRB3	414 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CASZ1	Q86V15	1759 aa		5.24	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	MYO1F	O00160	1098 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	BTN3A1	O00481	513 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D4	O60343	1298 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SLC5A1	P13866	664 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	BRAF	P15056	766 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CHRM3	P20309	590 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	KCNJ4	P48050	445 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	NEK3	P51956	506 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	FMO1	Q01740	532 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF844	Q08AG5	666 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	REST	Q13127	1097 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CNGA2	Q16280	664 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	GORAB	Q5T7V8	394 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TTC22	Q5TAA0	569 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TBCB	Q99426	244 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		5.23	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	LAMB2	P55268	1798 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	UFL1	O94874	794 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ZFPL1	O95159	310 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ABHD16A	O95870	558 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CFI	P05156	583 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	GRP	P07492	148 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	PIK3CB	P42338	1070 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	ARFIP2	P53365	341 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	CTBP1	Q13363	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	FOXE3	Q13461	319 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		5.22	□□□□□ -1.57
LINS1-210	ENST00000560934	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		5.22	□□□□□ -1.57

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