RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.03■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 ACP6Q9NPH0 428 aa22.03■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 CYLDQ9NQC7 956 aa22.03■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 NAGPAQ9UK23 515 aa22.03■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.03■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 MAN2B1O00754 1011 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 TPM2P07951 284 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF18P17022 549 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 ADIGQ0VDE8 80 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 PDGFRLQ15198 375 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC105Q8IYK2 499 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TMOD3-203ENST00000558455 SYCE3A1L190 88 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 FAM170BA6NMN3 283 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 TBX18O95935 607 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 GNA15P30679 374 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 CTHP32929 405 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 IFNAR2P48551 515 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 PSEN1P49768 467 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 RUNX3Q13761 415 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 FAM3CQ92520 227 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 MSANTD3Q96H12 275 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.01■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 THAP12O43422 761 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 ZBED1O96006 694 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 RARGP13631 454 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 RGS7P49802 495 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 EML3Q32P44 896 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 PM20D1Q6GTS8 502 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 PMF1Q6P1K2 205 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 LINC00597Q9H2U6 94 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 NUDT5Q9UKK9 219 aa22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 WDFY4Q6ZS81 3184 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 MED7O43513 233 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF165P49910 485 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 DENND1BQ6P3S1 775 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 CPA6Q8N4T0 437 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 PRSS33Q8NF86 280 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 ATP2A3Q93084 1043 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 NELL2Q99435 816 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 KCNH6Q9H252 994 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.99■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 LGALS16A8MUM7 142 aa21.98■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 MDM4O15151 490 aa21.98■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 GABBR2O75899 941 aa21.98■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 RALAP11233 206 aa21.98■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 ATP1A3P13637 1013 aa21.98■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 LCP1P13796 627 aa21.98■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 UCHL3P15374 230 aa21.98■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 KLK7P49862 253 aa21.98■■□□□ 1.11
TMOD3-203ENST00000558455 NUBP1P53384 320 aa21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms