RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		5.83	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	MASP2	O00187	686 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	VNN1	O95497	513 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRKCG	P05129	697 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC5A1	P13866	664 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	HGF	P14210	728 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ITPKB	P27987	946 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	RBL1	P28749	1068 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTGF	P29279	349 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM209B	Q5JX69	171 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	IL31	Q6EBC2	164 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	SKAP1	Q86WV1	359 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAFF	Q9ULX9	164 aa		5.82	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787		A8MVJ9	347 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787		H7C1Q1	480 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	GCAT	O75600	419 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	FGA	P02671	866 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCSK6	P29122	969 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	DGKQ	P52824	942 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNAB1	Q14722	419 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF566	Q969W8	418 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNX18	Q96RF0	628 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRR25	Q96S07	402 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CIPC	Q9C0C6	399 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		5.81	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	RASA4B	C9J798	803 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	BTBD19	C9JJ37	291 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	SMIM22	K7EJ46	135 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	RASA4	O43374	803 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERBB2	P04626	1255 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM225B	P0DP42	221 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSHR	P16473	764 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	TNFSF4	P23510	183 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATIC	P31939	592 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	TUBA4A	P68366	448 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	P3H2	Q8IVL5	708 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	PMM1	Q92871	262 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CERS4	Q9HA82	394 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		5.8	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A1W2PPC4	97 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	FGF18	O76093	207 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	USP1	O94782	785 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	PDE8B	O95263	885 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CERS1	P27544	350 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CYP4F2	P78329	520 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	GPS1	Q13098	491 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	BRD3	Q15059	726 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CYP1B1	Q16678	543 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	VSTM1	Q6UX27	236 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	OR2C3	Q8N628	320 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ASB2	Q96Q27	587 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		5.79	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PAPOLA-222	ENST00000556787	OVOL3	O00110	214 aa		5.78	□□□□□ -1.48

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