RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF605	Q86T29	641 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SFR1	Q86XK3	245 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PROSER1	Q86XN7	944 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CEP57	Q86XR8	500 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	FSIP1	Q8NA03	581 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CNNM3	Q8NE01	707 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SPATA18	Q8TC71	538 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NELL1	Q92832	810 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CRELD1	Q96HD1	420 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF558	Q96NG5	402 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ACAP3	Q96P50	834 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CASD1	Q96PB1	797 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	FZD8	Q9H461	694 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RSAD1	Q9HA92	442 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PARVG	Q9HBI0	331 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MIOS	Q9NXC5	875 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SPG21	Q9NZD8	308 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LAMA5	O15230	3695 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A087X0B3	334 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994		A0A1B0GUA9	196 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CARNS1	A5YM72	827 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ARL5C	A6NH57	179 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994		H0YCG3	227 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994		J3QKU1	62 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CLDN3	O15551	220 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF623	O75123	536 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	DDHD2	O94830	711 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CLSTN1	O94985	981 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TH	P07101	528 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GAP43	P17677	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LAG3	P18627	525 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GUCY2C	P25092	1073 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MLH1	P40692	756 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SYK	P43405	635 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SCNN1G	P51170	649 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	HK2	P52789	917 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LIMK1	P53667	647 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SPAG1	Q07617	926 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	UBXN11	Q5T124	520 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	RESP18	Q5W5W9	173 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ADAL	Q6DHV7	355 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	SULF2	Q8IWU5	870 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	DAW1	Q8N136	415 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC43	Q8N309	656 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	STK35	Q8TDR2	534 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC15	Q8TF66	581 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	HPS3	Q969F9	1004 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM169	Q96HH4	297 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ACCS	Q96QU6	501 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CWH43	Q9H720	699 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	CBX8	Q9HC52	389 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	KCND2	Q9NZV8	630 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATXN3-231	ENST00000554994	TBX20	Q9UMR3	447 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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