RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CCT6B	Q92526	530 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	SNX27	Q96L92	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	NELL2	Q99435	816 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	GDF15	Q99988	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	C1R	P00736	705 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	EBLN1	P0CF75	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	LIPA	P38571	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	RAB30	Q15771	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ICE2	Q659A1	982 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	EHD3	Q9NZN3	535 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM23-208	ENST00000553876	CGB1	A6NKQ9	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	KCNQ3	O43525	872 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PROP1	O75360	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CSF1R	P07333	972 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GPD1	P21695	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CD38	P28907	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ATIC	P31939	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GRK6	P43250	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZACN	Q401N2	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF213	O14771	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	NPC1	O15118	1278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ORC4	O43929	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	COQ9	O75208	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TTLL1	O95922	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	EGR1	P18146	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	DPF1	Q92782	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	NELL1	Q92832	810 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876		H0YIZ8	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM23-208	ENST00000553876	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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