RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 C1orf216Q8TAB5 229 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF560Q96MR9 790 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 ASB7Q9H672 318 aa25.1■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 OAS1P00973 400 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 GRIK1P39086 918 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 IL9RQ01113 521 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 GUCY1B3Q02153 619 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 TRIM29Q14134 588 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 CADM4Q8NFZ8 388 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 FGF11Q92914 225 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 FTSJ1Q9UET6 329 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.09■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 PRRT4C9JH25 899 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 CBX4O00257 560 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 HUS1O60921 280 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 BDNFP23560 247 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 MAGEA11P43364 429 aa25.08■■□□□ 1.61
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PRDM4-202ENST00000547188 USP49Q70CQ1 688 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 BBS7Q8IWZ6 715 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 SPATA17Q96L03 361 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 SPHK2Q9NRA0 654 aa25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PRDM4-202ENST00000547188 E2F8A0AVK6 867 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 PIGRP01833 764 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 C6P13671 934 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 KCNH2Q12809 1159 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 RTP5Q14D33 572 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 TTC38Q5R3I4 469 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 LAYNQ6UX15 382 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 IGSF22Q8N9C0 903 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 ENGASEQ8NFI3 743 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 SNX19Q92543 992 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 WBP2Q969T9 261 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM176AQ96HP8 235 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 ITM2CQ9NQX7 267 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 AGAP1Q9UPQ3 857 aa25.07■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 TISP43B9A030 160 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 H0YCG3 227 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 BRINP1O60477 761 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 JAK2O60674 1132 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 IL12RB1P42701 662 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 TAF10Q12962 218 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 FUT11Q495W5 492 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 KRT79Q5XKE5 535 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 SCFD1Q8WVM8 642 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 MYLPFQ96A32 169 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 OTUB2Q96DC9 234 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 TTLL2Q9BWV7 592 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 TRIM9Q9C026 710 aa25.06■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 NRSN2Q9GZP1 204 aa25.06■■□□□ 1.6
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PRDM4-202ENST00000547188 H0Y8X5 98 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 CCT8P50990 548 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 TPMTP51580 245 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 RHDQ02161 417 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 DNAJC3Q13217 504 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGAP40Q5TG30 622 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 FAM171BQ6P995 826 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM86AQ8N2M4 240 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 WBP1Q96G27 269 aa25.05■■□□□ 1.6
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PRDM4-202ENST00000547188 PLIN2Q99541 437 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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PRDM4-202ENST00000547188 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa25.05■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 TEX15Q9BXT5 2789 aa25.04■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 K7ENM7 598 aa25.04■■□□□ 1.6
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PRDM4-202ENST00000547188 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 HES3Q5TGS1 186 aa25.04■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 ADALQ6DHV7 355 aa25.04■■□□□ 1.6
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PRDM4-202ENST00000547188 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 ADGRF2Q8IZF7 708 aa25.04■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 PCDHGA12O60330 932 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 ITGB3P05106 788 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 PCSK1P29120 753 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 PPP3CCP48454 512 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 VSTM1Q6UX27 236 aa25.03■■□□□ 1.6
PRDM4-202ENST00000547188 ERICH1Q86X53 443 aa25.03■■□□□ 1.6
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