RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ASIC5	Q9NY37	505 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	HPSE	Q9Y251	543 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	PCSK5	Q92824	1860 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204		A0A087WZ62	844 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CLCA1	A8K7I4	914 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ADAMTS3	O15072	1205 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	TMPRSS11D	O60235	418 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	PHKG2	P15735	406 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CREB1	P16220	341 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	RBL1	P28749	1068 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	MCM5	P33992	734 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	COPA	P53621	1224 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	LMAN2	Q12907	356 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	DENND2C	Q68D51	928 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	PJA1	Q8NG27	643 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	FAM227B	Q96M60	508 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	SNX15	Q9NRS6	342 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1W2PPC4	97 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204		A8MVJ9	347 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	AREL1	O15033	823 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	SNX2	O60749	519 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	USP1	O94782	785 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CD19	P15391	556 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	FGFR2	P21802	821 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CERS1	P27544	350 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	EPHB2	P29323	1055 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	HTR7	P34969	479 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	STT3A	P46977	705 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CLCA4	Q14CN2	919 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ST3GAL2	Q16842	350 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	TBCB	Q99426	244 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	COL15A1	P39059	1388 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ANO9	A1A5B4	782 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	BTBD19	C9JJ37	291 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	PPP6C	O00743	305 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	KCNQ3	O43525	872 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	MT-CO3	P00414	261 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	TUBB4A	P04350	444 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CYP2D6	P10635	497 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CDK4	P11802	303 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	MPG	P29372	298 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ABCG1	P45844	678 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	TM4SF4	P48230	202 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	FAM187B	Q17R55	369 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CEP78	Q5JTW2	689 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	BEND5	Q7L4P6	421 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	NEK8	Q86SG6	692 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		3.61	□□□□□ -1.83
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC46	Q96FV0	321 aa		3.61	□□□□□ -1.83

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