RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543470.5

RPS6KC1-207, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ATP8B3O60423 1300 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ITGB4P16144 1822 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 HADHBP55084 474 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 PCSK7Q16549 785 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 MICALL2Q8IY33 904 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 THEM5Q8N1Q8 247 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 PTPRN2Q92932 1015 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 KCNK16Q96T55 309 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 LZTS1Q9Y250 596 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 LRP5O75197 1615 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 AKAP10O43572 662 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 OCA2Q04671 838 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 MAMLD1Q13495 774 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 RNF220Q5VTB9 566 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 MYH11P35749 1972 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ITGB3P05106 788 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 DAB2P98082 770 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 THAP11Q96EK4 314 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 SPATA17Q96L03 361 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 TPBGLP0DKB5 382 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 DSG3P32926 999 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 GTF2BQ00403 316 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ANO4Q32M45 955 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 CD101Q93033 1021 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 HPDLQ96IR7 371 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 FIZ1Q96SL8 496 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 C2CD2Q9Y426 696 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 LIASO43766 372 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ASMTLO95671 621 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 TCF4P15884 667 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 BMPR2Q13873 1038 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 INPP5DQ92835 1189 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 BTBD10Q9BSF8 475 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 PEX11AO75192 247 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 CACNA2D1P54289 1103 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 LBRQ14739 615 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 RASA2Q15283 850 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 GALNTL6Q49A17 601 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 SYT11Q9BT88 431 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 V9GYQ6 96 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 FCHO1O14526 889 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 CTSHP09668 335 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 GPD1P21695 349 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 IL10P22301 178 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ADSSP30520 456 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 SERPINB9P50453 376 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ARHGDIAP52565 204 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 DGKZQ13574 1117 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ARHGAP18Q8N392 663 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 IPMKQ8NFU5 416 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 APOL2Q9BQE5 337 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 TMX2Q9Y320 296 aa14.96□□□□□ -0.01
RPS6KC1-207ENST00000543470 ANGPT2O15123 496 aa14.96□□□□□ -0.02
RPS6KC1-207ENST00000543470 ATP6V1C1P21283 382 aa14.96□□□□□ -0.02
RPS6KC1-207ENST00000543470 NOVP48745 357 aa14.96□□□□□ -0.02
RPS6KC1-207ENST00000543470 NFIL3Q16649 462 aa14.96□□□□□ -0.02
RPS6KC1-207ENST00000543470 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.96□□□□□ -0.02
RPS6KC1-207ENST00000543470 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.96□□□□□ -0.02
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZNF677Q86XU0 584 aa14.96□□□□□ -0.02
RPS6KC1-207ENST00000543470 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.96□□□□□ -0.02
RPS6KC1-207ENST00000543470 UCMAQ8WVF2 138 aa14.96□□□□□ -0.02
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZNF606Q8WXB4 792 aa14.96□□□□□ -0.02
RPS6KC1-207ENST00000543470 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms