RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 ZSWIM3Q96MP5 696 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RDH12Q96NR8 316 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NMRK1Q9NWW6 199 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 MTMR4Q9NYA4 1195 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ICKQ9UPZ9 632 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RTL9Q8NET4 1388 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 VSTM5A8MXK1 200 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RTCAO00442 366 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CLOCKO15516 846 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RLN2P04090 185 aa3.25□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM228BP0C875 321 aa3.25□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 HTR2AP28223 471 aa3.25□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 ARFIP1P53367 373 aa3.25□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 DMTNQ08495 405 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 GNA13Q14344 377 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KCNAB1Q14722 419 aa3.25□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZMAT1Q5H9K5 638 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM26FQ5R3K3 315 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 EMBQ6PCB8 327 aa3.25□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.25□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D21Q8IYX1 336 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 OR5J2Q8NH18 312 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SGCDQ92629 289 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 NXNL1Q96CM4 212 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 OTUB2Q96DC9 234 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 BRD7Q9NPI1 651 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa3.25□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP3.25□□□□□ -1.897e-8■■■■□ 22.9
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JMJD1C-210ENST00000542921 GDAQ9Y2T3 454 aa3.25□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 ALDH1A2O94788 518 aa3.24□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 PIK3CGP48736 1102 aa3.24□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP3.24□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 C16orf89Q6UX73 402 aa3.24□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 CCNYL1Q8N7R7 359 aa3.24□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 DAGLBQ8NCG7 672 aa3.24□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.24□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 KLHL6Q8WZ60 621 aa3.24□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 OSBP2Q969R2 916 aa3.24□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 RTKNQ9BST9 563 aa3.24□□□□□ -1.89
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JMJD1C-210ENST00000542921 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.24□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 SOGA1O94964 1423 aa3.24□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 A0A0J9YVX5 310 aa3.24□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CIB4A0PJX0 185 aa3.24□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 K7ERI5 159 aa3.24□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 LARGE1O95461 756 aa3.24□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 CKMP06732 381 aa3.24□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 DARSP14868 501 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
JMJD1C-210ENST00000542921 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
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