RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 CD151P48509 253 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 C16orf89Q6UX73 402 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PACS1Q6VY07 963 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 SV2AQ7L0J3 742 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 MIER3Q7Z3K6 550 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ZNF410Q86VK4 478 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ATP2A3Q93084 1043 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ITPKCQ96DU7 683 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 NUF2Q9BZD4 464 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 SMYD3Q9H7B4 428 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ZNRF3Q9ULT6 936 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.24□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 E2F6O75461 281 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 OR6B1O95007 311 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 GNA15P30679 374 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 L1CAMP32004 1257 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 EPHB1P54762 984 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 MTTPP55157 894 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 NCOA4Q13772 614 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 LRRC36Q1X8D7 754 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 METTL21CQ5VZV1 264 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TIFABQ6ZNK6 161 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 GPD1LQ8N335 351 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 SLC25A41Q8N5S1 370 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TERB1Q8NA31 727 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ZFP28Q8NHY6 868 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 FBXO27Q8NI29 283 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 RTKNQ9BST9 563 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CYP26B1Q9NR63 512 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 HACD3Q9P035 362 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 VPS28Q9UK41 221 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TBX20Q9UMR3 447 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TEX264Q9Y6I9 313 aa11.23□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 C2orf71A6NGG8 1288 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 E5RJQ4 531 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 SLC22A2O15244 555 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 DNAJA2O60884 412 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 FAM163BP0C2L3 166 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ZNF23P17027 643 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 MMP8P22894 467 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PRKCHP24723 683 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 ELK3P41970 407 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 RARRES1P49788 294 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 EMP3P54852 163 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TUBA4AP68366 448 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TLR1Q15399 786 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 MYLK3Q32MK0 819 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 MSS51Q4VC12 460 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CYP2W1Q8TAV3 490 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 GCNAQ96QF7 691 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 GRIP2Q9C0E4 1043 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 VPS45Q9NRW7 570 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TBC1D23Q9NUY8 699 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 STK39Q9UEW8 545 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CNTN6Q9UQ52 1028 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 AP4B1Q9Y6B7 739 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.22□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 KBTBD13C9JR72 458 aa11.21□□□□□ -0.61
LMO3-215ENST00000537304 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms