RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535811.1

PARPBP-208, Transcript of PARP1 binding protein, human

TSL 2

Gene PARPBP, Length 1,465 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARPBP-208	ENST00000535811	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	IL1R2	P27930	398 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	DIO1	P49895	249 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	MTHFS	P49914	203 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	PGD	P52209	483 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	LMAN2	Q12907	356 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	PHKB	Q93100	1093 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	TTC17	Q96AE7	1141 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	STK31	Q9BXU1	1019 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	SNX15	Q9NRS6	342 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	COL15A1	P39059	1388 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	EXOC3	O60645	756 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	MT-CO3	P00414	261 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	MT-ND5	P03915	603 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	TPH1	P17752	444 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM187B	Q17R55	369 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	SNX22	Q96L94	193 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	AGPS	O00116	658 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	RGS10	O43665	173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	CYP2D6	P10635	497 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	HGF	P14210	728 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	CD19	P15391	556 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	ATF3	P18847	181 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	GATM	P50440	423 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	COPA	P53621	1224 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	ST3GAL2	Q16842	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	USP49	Q70CQ1	688 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	UNC13D	Q70J99	1090 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	KAZALD1	Q96I82	304 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	C5orf34	Q96MH7	638 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	RNF7	Q9UBF6	113 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	CLCA1	A8K7I4	914 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811		E5RJQ4	531 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811		F8W8V4	182 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	RAB27B	O00194	218 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	EXOC5	O00471	708 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	CES2	O00748	559 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	MOSPD3	O75425	235 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	MPG	P29372	298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	MCM5	P33992	734 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	FAM227B	Q96M60	508 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	TP73	O15350	636 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	CREB1	P16220	341 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	RBL1	P28749	1068 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	HTR7	P34969	479 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	CFHR3	Q02985	330 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	DAG1	Q14118	895 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	TMEM232	C9JQI7	657 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	IL18RAP	O95256	599 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	THBS4	P35443	961 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PARPBP-208	ENST00000535811	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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