RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533259.1

PDE4DIP-231, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 4

Gene PDE4DIP, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-231	ENST00000533259	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NDST4	Q9H3R1	872 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	11.37	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CHD6	Q8TD26	2715 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PTPRD	P23468	1912 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ANTXRL	A6NF34	631 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HLA-DRA	P01903	254 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	USP17L7	P0C7H9	530 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TCF3	P15923	654 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PCSK1	P29120	753 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	AMPD2	Q01433	879 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MYO1E	Q12965	1108 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	USP4	Q13107	963 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GAB4	Q2WGN9	574 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZACN	Q401N2	412 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PLK5	Q496M5	336 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FBXO43	Q4G163	708 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GBP6	Q6ZN66	633 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DPH6	Q7L8W6	267 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HPDL	Q96IR7	371 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SPATA17	Q96L03	361 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NME7	Q9Y5B8	376 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		11.36	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DCLK1	O15075	740 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HDC	P19113	662 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	BDNF	P23560	247 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MYL6	P60660	151 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	USP46	P62068	366 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LRMP	Q12912	555 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MIIP	Q5JXC2	388 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CPA6	Q8N4T0	437 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SEMA4D	Q92854	862 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CD101	Q93033	1021 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	HHIP	Q96QV1	700 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SYT15	Q9BQS2	421 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TRIM5	Q9C035	493 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	RAB20	Q9NX57	234 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	EBF1	Q9UH73	591 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CDH9	Q9ULB4	789 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NUP205	Q92621	2012 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	LGALS16	A8MUM7	142 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259		K7EQS6	105 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	P4HA2	O15460	535 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TEX33	O43247	280 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	VNN1	O95497	513 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CKM	P06732	381 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	TPM3	P06753	285 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	OPRD1	P41143	372 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	IFNAR2	P48551	515 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	DMC1	Q14565	340 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	NR1I3	Q14994	352 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ZNF699	Q32M78	642 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	STPG1	Q5TH74	334 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	VSTM1	Q6UX27	236 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	MYLPF	Q96A32	169 aa		11.34	□□□□□ -0.59
PDE4DIP-231	ENST00000533259	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		11.34	□□□□□ -0.59

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