RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF852Q6ZMS4 543 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 OSCP1Q8WVF1 389 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 CYLDQ9NQC7 956 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ZBED1O96006 694 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 RARGP13631 454 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 COL9A1P20849 921 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 VCPP55072 806 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 PTK2Q05397 1052 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ADIGQ0VDE8 80 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 MEA1Q16626 185 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1958Q8N8K9 716 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 RIN3Q8TB24 985 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 HSFY1Q96LI6 401 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 NELL2Q99435 816 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ULBP1Q9BZM6 244 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 NMUR1Q9HB89 426 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 GTSE1Q9NYZ3 720 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 CLIC5Q9NZA1 410 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 FHOD1Q9Y613 1164 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 LGALS16A8MUM7 142 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 UCHL3P15374 230 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 BPIFB4P59827 614 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 RUNX3Q13761 415 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 UBXN2BQ14CS0 331 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF276Q8N554 614 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 EBF3Q9H4W6 596 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 LTB4R2Q9NPC1 389 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 CNGB3Q9NQW8 809 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 SIT1Q9Y3P8 196 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-222ENST00000532751 COL4A3Q01955 1670 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 NCAM2O15394 837 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 CAVIN2O95810 425 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 LCP1P13796 627 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 PGFP49763 221 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 RGS7P49802 495 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 NUBP1P53384 320 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 ZXDBP98169 803 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 UBXN1Q04323 297 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 TNK2Q07912 1038 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 PMF1Q6P1K2 205 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 KLHDC10Q6PID8 442 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 SCD5Q86SK9 330 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM105Q8N8V8 129 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 PJA1Q8NG27 643 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 TTC8Q8TAM2 541 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 FAM3CQ92520 227 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 ATP2A3Q93084 1043 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 PRRX2Q99811 253 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 OSBPL6Q9BZF3 934 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 FOXQ1Q9C009 403 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 OSER1Q9NX31 292 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 CFAP97Q9P2B7 532 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 ATP1A3P13637 1013 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 CD72P21854 359 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 GPD2P43304 727 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 TPM4P67936 248 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 AMPD2Q01433 879 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 C10orf120Q5SQS8 335 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 SCML4Q8N228 414 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 CPA6Q8N4T0 437 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 STK33Q9BYT3 514 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 KCNH6Q9H252 994 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 ACP6Q9NPH0 428 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRK-222ENST00000532751 HPS4Q9NQG7 708 aa23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms