RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ERGIC2Q96RQ1 377 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CYLDQ9NQC7 956 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 OSER1Q9NX31 292 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CPQQ9Y646 472 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 TLR5O60602 858 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 STARD6P59095 220 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 PTK2Q05397 1052 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 PM20D1Q6GTS8 502 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 PMF1Q6P1K2 205 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SCD5Q86SK9 330 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SHDQ96IW2 340 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM83CQ9BQN1 747 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 STK33Q9BYT3 514 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ULBP1Q9BZM6 244 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D17Q9HA65 648 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 NAGPAQ9UK23 515 aa20■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 F8VZ95 297 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 LEFTY2O00292 366 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ZBED1O96006 694 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CLCN1P35523 988 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 GPD2P43304 727 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 RGS7P49802 495 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 TPRG1Q6ZUI0 275 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 LUZP1Q86V48 1076 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SCML4Q8N228 414 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP18Q8N392 663 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 FLCNQ8NFG4 579 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 HSFY1Q96LI6 401 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 NACA2Q9H009 215 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CNGB3Q9NQW8 809 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 GKN1Q9NS71 199 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SMPD4Q9NXE4 827 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CLIC5Q9NZA1 410 aa19.99■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 EPHB6O15197 1021 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 RARGP13631 454 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 BPIFB4P59827 614 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 TPM4P67936 248 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 DENND1BQ6P3S1 775 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 KLHDC10Q6PID8 442 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 BHLHA9Q7RTU4 235 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC47A2Q86VL8 602 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF276Q8N554 614 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 KIAA1958Q8N8K9 716 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 TTC16Q8NEE8 873 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 OSCP1Q8WVF1 389 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 GTSE1Q9NYZ3 720 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHGC3Q9UN70 934 aa19.98■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 GABBR2O75899 941 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 RALAP11233 206 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 LCP1P13796 627 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 RPL34P49207 117 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 TNK2Q07912 1038 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 PDGFRLQ15198 375 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 FILIP1LQ4L180 1135 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM68Q6AZZ1 485 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 TADA2BQ86TJ2 420 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 NEK11Q8NG66 645 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 HPS4Q9NQG7 708 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CFAP97Q9P2B7 532 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 PIAS3Q9Y6X2 628 aa19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 KANSL1LA0AUZ9 987 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 TEX33O43247 280 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 TBX18O95935 607 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 GLULP15104 373 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 AOC1P19801 751 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ACADSBP45954 432 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 IFNAR2P48551 515 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 CLCN5P51795 746 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 VCPP55072 806 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 JAM2P57087 298 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 DAOAP59103 153 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 STK32AQ8WU08 396 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 MSANTD3Q96H12 275 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 EBF3Q9H4W6 596 aa19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3-208ENST00000531226 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
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