RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 SMOQ99835 787 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D14Q9P2M4 693 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 HMGXB4Q9UGU5 601 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 USP24Q9UPU5 2620 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 ALDH1A2O94788 518 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 GRIA2P42262 883 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 IRX4P78413 519 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 PKP1Q13835 747 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 PHTF2Q8N3S3 785 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 SMARCD1Q96GM5 515 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 VRTNQ9H8Y1 702 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM49BQ9NUQ9 324 aa25.46■■□□□ 1.67
PTPRJ-205ENST00000527952 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TBC1D3BA6NDS4 549 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 MAP3K13O43283 966 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 WASP42768 502 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 NDST1P52848 882 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 MAP3K7CLP57077 242 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 GAD2Q05329 585 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 ANO4Q32M45 955 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 UAP1L1Q3KQV9 507 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 KMT5BQ4FZB7 885 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 C11orf74Q86VG3 221 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM25Q86YD3 366 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 KIAA1958Q8N8K9 716 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC2A14Q8TDB8 520 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TNIP3Q96KP6 325 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 NACA2Q9H009 215 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 DMAC2Q9NW81 257 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TULP3O75386 442 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TBX18O95935 607 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 P2RY2P41231 377 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 PTGER3P43115 390 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 EOGTQ5NDL2 527 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 DEFB119Q8N690 84 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 C12orf29Q8N999 325 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 PAGE5Q96GU1 130 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM9BQ9NQ34 198 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 EXOC1Q9NV70 894 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 IL37Q9NZH6 218 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 CEP192Q8TEP8 1941 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 A0A0A0MRY4 1105 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 ADORA2BP29275 332 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TNFRSF4P43489 277 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 CLDN10P78369 228 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 SNX30Q5VWJ9 437 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 BTBD8Q5XKL5 378 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 WHAMMQ8TF30 809 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 SPHK2Q9NRA0 654 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM74BQ9NUR3 256 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 PI4KAP42356 2102 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 AP3M2P53677 418 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 CEP135Q66GS9 1140 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 LPCAT2Q7L5N7 544 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 DEC1Q9P2X7 70 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 HCN2Q9UL51 889 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TLR5O60602 858 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 NR3C1P04150 777 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 SLFN14P0C7P3 912 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 SPINK2P20155 84 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 FOXC1Q12948 553 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 MAP7D1Q3KQU3 841 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 ZACNQ401N2 412 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TRIM61Q5EBN2 209 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 SV2AQ7L0J3 742 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 MIB1Q86YT6 1006 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 SNX21Q969T3 373 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 OTUB2Q96DC9 234 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 SPACA7Q96KW9 195 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 TWNKQ96RR1 684 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRJ-205ENST00000527952 FSCN3Q9NQT6 498 aa25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms