RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 DGCR2P98153 550 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP8Q13202 625 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ADAM15Q13444 863 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 IL10RAQ13651 578 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 NFYCQ13952 458 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 RAB30Q15771 203 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 AAK1Q2M2I8 961 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ASPRV1Q53RT3 343 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CLEC14AQ86T13 490 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 RSAD2Q8WXG1 361 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CFHR4Q92496 578 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 C8orf48Q96LL4 319 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 DMRTA2Q96SC8 542 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 IWS1Q96ST2 819 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 KATNAL1Q9BW62 490 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ARMT1Q9H993 441 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SIK3Q9Y2K2 1263 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 RLFQ13129 1914 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 LAMA4Q16363 1823 aa4.83□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 FSD2A1L4K1 749 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF213O14771 459 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA0355O15063 1070 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CAND2O75155 1236 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CNMDO75829 334 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFB10O96000 172 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MYBP10242 640 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ACTN1P12814 892 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 AKR1B1P15121 316 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CTSSP25774 331 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 NOVP48745 357 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 DSC2Q02487 901 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 HGFACQ04756 655 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 FPGSQ05932 587 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 DPTQ07507 201 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MALLQ13021 153 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SPIDRQ14159 915 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ANO4Q32M45 955 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CASC1Q6TDU7 716 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 BTNL9Q6UXG8 535 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 TMTC2Q8N394 836 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ACER1Q8TDN7 264 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MORC4Q8TE76 937 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SCFD2Q8WU76 684 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 LRGUKQ96M69 825 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 WDR92Q96MX6 357 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 OR14A2Q96R54 314 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MAP3K14Q99558 947 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 GLT8D2Q9H1C3 349 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MSL2Q9HCI7 577 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ING3Q9NXR8 418 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 STX8Q9UNK0 236 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 NR2E1Q9Y466 385 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 BRCA2P51587 3418 aa4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ABCB11O95342 1321 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC171Q6TFL3 1326 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 EMSYQ7Z589 1322 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PRG0 241 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC154A6NI56 674 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP6O43182 974 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 BAIAP3O94812 1187 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 IL33O95760 270 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 TGFB3P10600 412 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 PDCP20941 246 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 SMARCA1P28370 1054 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 KIF5BP33176 963 aa4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
HDAC2-216ENST00000523628 MRE11P49959 708 aa4.81□□□□□ -1.64
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