RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521220.1

CCDC25-208, Transcript of coiled-coil domain containing 25, human

TSL 2

Gene CCDC25, Length 613 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC25-208	ENST00000521220	TNKS	O95271	1327 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MYO1C	O00159	1063 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	TULP2	O00295	520 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CES2	O00748	559 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	DYNC1I1	O14576	645 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PMPCB	O75439	489 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	KATNA1	O75449	491 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	POU2F2	P09086	479 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CTSA	P10619	480 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC11A2	P49281	568 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	UCP3	P55916	312 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	LMAN2	Q12907	356 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MLC1	Q15049	377 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MNS1	Q8NEH6	495 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	NCAPD3	P42695	1498 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	VNN1	O95497	513 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PRKAG1	P54619	331 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220		A0A087WWL8	130 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ANP32C	O43423	234 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	TTC3	P53804	2025 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	HSF1	Q00613	529 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.25	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	TGFB3	P10600	412 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	BCAT1	P54687	386 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	HYAL1	Q12794	435 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	TRDN	Q13061	729 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CCNI	Q14094	377 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	KCNB1	Q14721	858 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	SEC23B	Q15437	767 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	OFD1	O75665	1012 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	AKAP5	P24588	427 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	DIO1	P49895	249 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CCDC25-208	ENST00000521220	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.23	□□□□□ -1.73

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