RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.39■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 SDCBP2Q9H190 292 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.39■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 C12orf29Q8N999 325 aa20.36■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 SGK1O00141 431 aa20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 SPOPLQ6IQ16 392 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 HMGB4Q8WW32 186 aa20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 EML5Q05BV3 1969 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 ANTXRLA6NF34 631 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 C4orf47A7E2U8 309 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 TULP3O75386 442 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 HTR3DQ70Z44 454 aa20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM25Q86YD3 366 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 PIGKQ92643 395 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 SCML2Q9UQR0 700 aa20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP2-220ENST00000511663 DNAH14Q0VDD8 3507 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-220ENST00000511663 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.33■□□□□ 0.85
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