RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511398.1

LNX1-207, Transcript of ligand of numb-protein X 1, humanhuman

TSL 4

Gene LNX1, Length 622 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX1-207ENST00000511398 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 TWNKQ96RR1 684 aa8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 NUP58Q9BVL2 599 aa8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 STK33Q9BYT3 514 aa8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 CEP72Q9P209 647 aa8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 MYO10Q9HD67 2058 aa8.28□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.27□□□□□ -1.08
LNX1-207ENST00000511398 PATJQ8NI35 1801 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 A0A1W2PQC6 194 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 ANKRD33BA6NCL7 494 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 TMEM221A6NGB7 291 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 F8VZ95 297 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 M0R296 226 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 CYP26A1O43174 497 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 TEX33O43247 280 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 ICMTO60725 284 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 GFPT2O94808 682 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 RHOP08100 348 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 POU2F2P09086 479 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SETSIPP0DME0 302 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 ATF6P18850 670 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 GABRR2P28476 465 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 GPR15P49685 360 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 MRE11P49959 708 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SNX16P57768 344 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 ARID5AQ03989 594 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SDHAF4Q5VUM1 108 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 DRC7Q8IY82 874 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 FUKQ8N0W3 1084 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 NUP93Q8N1F7 819 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 MSANTD4Q8NCY6 345 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 STKLD1Q8NE28 680 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 WHAMMQ8TF30 809 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 ING5Q8WYH8 240 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SHC3Q92529 594 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 GOLGA1Q92805 767 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 EDAQ92838 391 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 FBXO32Q969P5 355 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SPATA17Q96L03 361 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 C8orf48Q96LL4 319 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 PKMYT1Q99640 499 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 DUSP16Q9BY84 665 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 NACA2Q9H009 215 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 FBXO44Q9H4M3 255 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 POMKQ9H5K3 350 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SYNCQ9H7C4 482 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 LRRC4Q9HBW1 653 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SIX2Q9NPC8 291 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 ST7Q9NRC1 585 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 NME7Q9Y5B8 376 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.27□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 FRYLO94915 3013 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 A0A1W2PRU2 124 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 MICAL2O94851 1124 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 VNN2O95498 520 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 FERP16591 822 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 ACO1P21399 889 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 YWHAQP27348 245 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SOX5P35711 763 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SLC19A1P41440 591 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 SLC5A3P53794 718 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 GDF10P55107 478 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 NTHL1P78549 312 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 NHLH1Q02575 133 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 TRIM14Q14142 442 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 NR1I3Q14994 352 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 ASIC2Q16515 512 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 PTPN21Q16825 1174 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.26□□□□□ -1.09
LNX1-207ENST00000511398 UBA3Q8TBC4 463 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms