RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 R4GN57 208 aa19.72■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP17A1P05093 508 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 SP9P0CG40 484 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 NBL1P41271 181 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF132P52740 706 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 GCNT1Q02742 428 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 PDE4CQ08493 712 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM65Q6PJ69 517 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 CPA6Q8N4T0 437 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD52Q8NB46 1076 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 UBA3Q8TBC4 463 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP2A3Q93084 1043 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 CYLDQ9NQC7 956 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 USP3Q9Y6I4 520 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 PIEZO1Q92508 2521 aa19.71■□□□□ 0.75
SH3BP2-218ENST00000511185 FRYLO94915 3013 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 NCAM2O15394 837 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 EGFP01133 1207 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC9A1P19634 815 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEA9P43362 315 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 BCAT1P54687 386 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 CETN1Q12798 172 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB41Q5JT25 222 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 BHLHA9Q7RTU4 235 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC186Q7Z3E2 898 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 THAP9Q9H5L6 903 aa19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP19.7■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 ANTXRLA6NF34 631 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 LAMTOR5O43504 91 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 VDRP11473 427 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 TDGF1P13385 188 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 SATB1Q01826 763 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 ADIGQ0VDE8 80 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 BST2Q10589 180 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 PKDCCQ504Y2 493 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM196Q5HYL7 178 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 MIIPQ5JXC2 388 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf228Q6PIY5 440 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 C12orf40Q86WS4 652 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 BBS7Q8IWZ6 715 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAI2Q9GZS0 605 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 NACA2Q9H009 215 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 ACP6Q9NPH0 428 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 NAGPAQ9UK23 515 aa19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP19.69■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 M0QYV0 167 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3R2O00459 728 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 GREM1O60565 184 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 GABBR2O75899 941 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 NFATC1O95644 943 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 PAEPP09466 180 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 RARGP13631 454 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 OPRD1P41143 372 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 TKTL1P51854 596 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 MESP2Q0VG99 397 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC32Q14392 662 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 ULBP1Q9BZM6 244 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 SIX2Q9NPC8 291 aa19.68■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT5P13647 590 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G4AP47712 749 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS7P49802 495 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 GALK1P51570 392 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 MAN2A1Q16706 1144 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 ASCL5Q7RTU5 278 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 SFTPA1Q8IWL2 248 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 P2RY13Q9BPV8 354 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 HESX1Q9UBX0 185 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 DACH1Q9UI36 760 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP19.67■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 BECN2A8MW95 431 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 PROB1E7EW31 1015 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA6L22H0YM25 854 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 PON1P27169 355 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 DMWDQ09019 674 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 DHCR24Q15392 516 aa19.66■□□□□ 0.74
SH3BP2-218ENST00000511185 DGKKQ5KSL6 1271 aa19.66■□□□□ 0.74
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