RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 DTX2Q86UW9 622 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 GPC2Q8N158 579 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 DDB2Q92466 427 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 FAM136AQ96C01 138 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 FAM167AQ96KS9 214 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 FLRT1Q9NZU1 646 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 RAD54BQ9Y620 910 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 LTBP1Q14766 1721 aa5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 RTL1A6NKG5 1358 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 KDRP35968 1356 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 DCLK1O15075 740 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 VPS4BO75351 444 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 DNAJB5O75953 348 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 PHKG2P15735 406 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 CHRM3P20309 590 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 ITGALP20701 1170 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 AKAP5P24588 427 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF81P51508 661 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 FAM153CQ494X1 144 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 JDP2Q8WYK2 163 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 LMBRD1Q9NUN5 540 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 PNPOQ9NVS9 261 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 NR2E3Q9Y5X4 410 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 THSD7BQ9C0I4 1608 aa5.8□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 WDR91A4D1P6 747 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF213O14771 459 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 DTNBO60941 627 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 AHSGP02765 367 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 CD6P30203 668 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF134P52741 427 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 TBCCQ15814 346 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 PGS1Q32NB8 556 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 CATIPQ7Z7H3 387 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 KLHDC4Q8TBB5 520 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 REPS1Q96D71 796 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 NELL2Q99435 816 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 RNF186Q9NXI6 227 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 HESX1Q9UBX0 185 aa5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 LINC01548A6NM66 108 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 ERVV-2B6SEH9 535 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 HDCP19113 662 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 EPS15P42566 896 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 CCT8P50990 548 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 HUNKP57058 714 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 PLS1Q14651 629 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 CAMKK1Q8N5S9 505 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 MVB12AQ96EY5 273 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 MASTLQ96GX5 879 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 HOMER2Q9NSB8 354 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 NARFQ9UHQ1 456 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.78□□□□□ -1.48
PDE4D-217ENST00000509355 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 TARM1B6A8C7 271 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 PPM1DO15297 605 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 PDHA1P08559 390 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 ATAT1Q5SQI0 421 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 RGMBQ6NW40 437 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 SCARB1Q8WTV0 552 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 HPS3Q969F9 1004 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF778Q96MU6 729 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 PADI4Q9UM07 663 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1W2PP64 1363 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms